RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 GGT6Q6P531 493 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 TEX35Q5T0J7 233 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 DAPK1P53355 1430 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CFTRP13569 1480 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 HMMRO75330 724 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC66A2RUB6 948 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CDR1P51861 262 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 ST18O60284 1047 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 RGL3Q3MIN7 710 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 CAGE1Q8TC20 777 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 MCM2P49736 904 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL34Q8N239 644 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 KIF3BO15066 747 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0G2JS52 829 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 NESP48681 1621 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 RNF20Q5VTR2 975 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 MIER1Q8N108 512 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHG5O94827 1062 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 NLRP13Q86W25 1043 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 TUBB4BP68371 445 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 IGF1RP08069 1367 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 USP8P40818 1118 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 TIAM1Q13009 1591 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 NUP155O75694 1391 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 MYO6Q9UM54 1294 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 TPM1P09493 284 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 NUCB2P80303 420 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 FOXD1Q16676 465 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 FAM107BQ9H098 131 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 VGFO15240 615 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 NBR1Q14596 966 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF428Q96B54 188 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 HFM1A2PYH4 1435 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 PKD2Q13563 968 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 SYNJ2O15056 1496 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 INSRP06213 1382 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 FAM161AQ3B820 660 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 REC8O95072 547 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-201ENST00000355233 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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