RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 CHD1O14646 1710 aa26.15■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.15■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
NHLH2-201ENST00000320238 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
NHLH2-201ENST00000320238 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.12■■□□□ 1.77
NHLH2-201ENST00000320238 PREX2Q70Z35 1606 aa26.12■■□□□ 1.77
NHLH2-201ENST00000320238 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.12■■□□□ 1.77
NHLH2-201ENST00000320238 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NHLH2-201ENST00000320238 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.11■■□□□ 1.77
NHLH2-201ENST00000320238 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
NHLH2-201ENST00000320238 PLA2R1Q13018 1463 aa26.08■■□□□ 1.77
NHLH2-201ENST00000320238 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.04■■□□□ 1.76
NHLH2-201ENST00000320238 NUDCQ9Y266 331 aa26.02■■□□□ 1.76
NHLH2-201ENST00000320238 ABCC2Q92887 1545 aa26.01■■□□□ 1.75
NHLH2-201ENST00000320238 AFAP1Q8N556 730 aa26■■□□□ 1.75
NHLH2-201ENST00000320238 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
NHLH2-201ENST00000320238 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.99■■□□□ 1.75
NHLH2-201ENST00000320238 A2MP01023 1474 aa25.99■■□□□ 1.75
NHLH2-201ENST00000320238 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
NHLH2-201ENST00000320238 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.98■■□□□ 1.75
NHLH2-201ENST00000320238 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
NHLH2-201ENST00000320238 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.96■■□□□ 1.75
NHLH2-201ENST00000320238 SHROOM2Q13796 1616 aa25.95■■□□□ 1.74
NHLH2-201ENST00000320238 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.94■■□□□ 1.74
NHLH2-201ENST00000320238 MSH5O43196 834 aa25.94■■□□□ 1.74
NHLH2-201ENST00000320238 RALBP1Q15311 655 aa25.94■■□□□ 1.74
NHLH2-201ENST00000320238 TESK2Q96S53 571 aa25.92■■□□□ 1.74
NHLH2-201ENST00000320238 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.92■■□□□ 1.74
NHLH2-201ENST00000320238 PLCH2O75038 1416 aa25.92■■□□□ 1.74
NHLH2-201ENST00000320238 PANK3Q9H999 370 aa25.9■■□□□ 1.74
NHLH2-201ENST00000320238 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
NHLH2-201ENST00000320238 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.89■■□□□ 1.74
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NHLH2-201ENST00000320238 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 UNC13BO14795 1591 aa25.88■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.88■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.87■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.86■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 NLRP13Q86W25 1043 aa25.86■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.83■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.83■■□□□ 1.73
NHLH2-201ENST00000320238 PLXNC1O60486 1568 aa25.82■■□□□ 1.72
NHLH2-201ENST00000320238 ERBINQ96RT1 1412 aa25.82■■□□□ 1.72
NHLH2-201ENST00000320238 TMF1P82094 1093 aa25.82■■□□□ 1.72
NHLH2-201ENST00000320238 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.82■■□□□ 1.72
NHLH2-201ENST00000320238 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.81■■□□□ 1.72
NHLH2-201ENST00000320238 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.79■■□□□ 1.72
NHLH2-201ENST00000320238 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.78■■□□□ 1.72
NHLH2-201ENST00000320238 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
NHLH2-201ENST00000320238 ABCC1P33527 1531 aa25.77■■□□□ 1.72
NHLH2-201ENST00000320238 KIF3BO15066 747 aa25.76■■□□□ 1.71
NHLH2-201ENST00000320238 E9PCH4 1651 aa25.76■■□□□ 1.71
NHLH2-201ENST00000320238 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
NHLH2-201ENST00000320238 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.73■■□□□ 1.71
NHLH2-201ENST00000320238 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.73■■□□□ 1.71
NHLH2-201ENST00000320238 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.71■■□□□ 1.71
NHLH2-201ENST00000320238 ATP10AO60312 1499 aa25.71■■□□□ 1.71
NHLH2-201ENST00000320238 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.7■■□□□ 1.7
NHLH2-201ENST00000320238 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.69■■□□□ 1.7
NHLH2-201ENST00000320238 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.69■■□□□ 1.7
NHLH2-201ENST00000320238 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.69■■□□□ 1.7
NHLH2-201ENST00000320238 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
NHLH2-201ENST00000320238 BCL11AQ9H165 835 aa25.66■■□□□ 1.7
NHLH2-201ENST00000320238 PLIN1O60240 522 aa25.66■■□□□ 1.7
NHLH2-201ENST00000320238 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.65■■□□□ 1.7
NHLH2-201ENST00000320238 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.65■■□□□ 1.7
NHLH2-201ENST00000320238 FANCAO15360 1455 aa25.64■■□□□ 1.69
NHLH2-201ENST00000320238 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.64■■□□□ 1.69
NHLH2-201ENST00000320238 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.63■■□□□ 1.69
NHLH2-201ENST00000320238 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
NHLH2-201ENST00000320238 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.62■■□□□ 1.69
NHLH2-201ENST00000320238 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.61■■□□□ 1.69
NHLH2-201ENST00000320238 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.6■■□□□ 1.69
NHLH2-201ENST00000320238 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.59■■□□□ 1.69
NHLH2-201ENST00000320238 KANK1Q14678 1352 aa25.58■■□□□ 1.69
NHLH2-201ENST00000320238 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
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NHLH2-201ENST00000320238 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.57■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 LAMC1P11047 1609 aa25.57■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.56■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 ADGRL1O94910 1474 aa25.56■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
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NHLH2-201ENST00000320238 MADDQ8WXG6 1647 aa25.55■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 TRPM2O94759 1503 aa25.55■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 PDE3BQ13370 1112 aa25.55■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 PTPRTO14522 1441 aa25.54■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 ATP7AQ04656 1500 aa25.53■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
NHLH2-201ENST00000320238 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
NHLH2-201ENST00000320238 ASXL2Q76L83 1435 aa25.5■■□□□ 1.67
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.5■■□□□ 1.67
NHLH2-201ENST00000320238 SKAP1Q86WV1 359 aa25.49■■□□□ 1.67
NHLH2-201ENST00000320238 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
NHLH2-201ENST00000320238 GGT6Q6P531 493 aa25.48■■□□□ 1.67
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