RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214547.1

Neo1-202, Transcript of Neogenin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Neo1, Length 5,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ccnb3Q810T2 1396 aa24,95■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 R3hcc1Q8BSI6 488 aa24,94■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 UacaQ8CGB3 1411 aa24,94■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 CftrP26361 1476 aa24,94■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ccdc146E9Q9F7 977 aa24,94■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Q3TQI7 289 aaKnown RBP24,94■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ggt6Q6PDE7 497 aa24,93■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 MecomP14404 1042 aa24,93■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Rsph4aQ8BYM7 716 aa24,93■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Cspp1B2RX88 1205 aa24,92■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Inpp5dQ9ES52 1191 aa24,92■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP24,91■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Cux2P70298 1426 aa24,91■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Rfx1P48377 963 aa24,9■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Pak3Q61036 559 aa24,89■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Cgnl1Q6AW69 1298 aa24,89■■□□□ 1,58
Neo1-202ENSMUST00000214547 Sycp2Q9CUU3 1500 aa24,88■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Fbxo2Q80UW2 297 aa24,88■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP24,88■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Esx1O88933 382 aa24,87■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Carmil1Q6EDY6 1374 aa24,87■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Casq1O09165 405 aa24,86■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP24,86■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Pdcl3Q8BVF2 240 aa24,86■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Tnnt1O88346 262 aa24,86■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Tsen2Q6P7W5 460 aa24,85■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP24,84■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP24,83■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Rabep1O35551 862 aa24,83■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ccdc60Q8C4J0 545 aa24,83■■□□□ 1,57
Neo1-202ENSMUST00000214547 Brpf1B2RRD7 1212 aa24,83■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Map7d2A2AG50 781 aa24,81■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 St18Q80TY4 1045 aa24,81■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Dapk1Q80YE7 1442 aa24,81■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP24,8■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa24,8■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Kif16bB1AVY7 1312 aa24,8■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ttll13A4Q9F6 804 aa24,79■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Pibf1E9Q6K3 756 aa24,79■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Stard8Q8K031 1019 aa24,79■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa24,79■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ralbp1Q62172 648 aa24,79■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Fan1Q69ZT1 1020 aa24,79■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24,78■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Trim58Q5NCC9 485 aa24,78■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa24,78■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 IbspQ61711 324 aa24,78■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Filip1lQ6P6L0 1131 aa24,77■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24,77■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP24,77■■□□□ 1,56
Neo1-202ENSMUST00000214547 Smarca2Q6DIC0 1577 aa24,76■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 Synj1Q8CHC4 1574 aa24,76■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa24,76■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 HdgfP51859 237 aaKnown RBP24,76■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa24,76■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 Fam184bQ0KK56 942 aa24,75■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 Kif7B7ZNG0 1348 aa24,75■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 Zscan10Q3URR7 782 aa24,74■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 GsdmaQ9EST1 446 aa24,74■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 AampJ3QN89 436 aa24,73■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP24,73■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ccdc183A2AJB1 534 aa24,72■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP24,72■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP24,71■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 Kif3bQ61771 747 aa24,7■■□□□ 1,55
Neo1-202ENSMUST00000214547 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP24,7■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ccer1Q9CQL2 403 aa24,7■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP24,69■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Gripap1Q8VD04 806 aa24,68■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ccdc30Q8BVF4 654 aa24,68■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 CenpjQ569L8 1344 aa24,68■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Kif4P33174 1231 aa24,67■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Nap1l3Q794H2 544 aa24,67■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Washc2Q6PGL7 1334 aa24,66■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Atl3Q91YH5 541 aa24,66■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP24,66■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Psme1P97371 249 aa24,65■■□□□ 1,54
Neo1-202ENSMUST00000214547 Pank1Q8K4K6 548 aa24,64■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Tomm22Q9CPQ3 142 aa24,64■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa24,64■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP24,63■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Txndc2Q6P902 515 aa24,62■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa24,61■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP24,61■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP24,6■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Taf3Q5HZG4 932 aa24,6■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Ipo4Q8VI75 1082 aa24,6■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP24,59■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Usp40Q8BWR4 1235 aa24,59■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Mical1Q8VDP3 1048 aa24,59■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 KinQ8K339 391 aa24,58■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Stk31Q99MW1 1018 aa24,58■■□□□ 1,53
Neo1-202ENSMUST00000214547 Plekhh1Q80TI1 1356 aa24,58■■□□□ 1,52
Neo1-202ENSMUST00000214547 Polr3gQ6NXY9 223 aa24,56■■□□□ 1,52
Neo1-202ENSMUST00000214547 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa24,56■■□□□ 1,52
Neo1-202ENSMUST00000214547 Triml2E9PW10 424 aa24,55■■□□□ 1,52
Neo1-202ENSMUST00000214547 Phactr2B1AVP0 632 aa24,55■■□□□ 1,52
Neo1-202ENSMUST00000214547 Tpm2P58774 284 aa24,55■■□□□ 1,52
Neo1-202ENSMUST00000214547 Samd1D3YXK1 519 aa24,55■■□□□ 1,52
Neo1-202ENSMUST00000214547 Tpd52l1O54818 204 aa24,55■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26 ms