RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000196264.4

Lmo4-207, Transcript of LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Lmo4, Length 1,263 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Tdrd9Q14BI7 1383 aa24.02■■□□□ 1.44
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Tom1O88746 492 aa24.01■■□□□ 1.43
Lmo4-207ENSMUST00000196264 NinlQ6ZQ12 1394 aa24.01■■□□□ 1.43
Lmo4-207ENSMUST00000196264 DnmbpQ6TXD4 1580 aa23.99■■□□□ 1.43
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Map3k5O35099 1380 aa23.98■■□□□ 1.43
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fhod3Q76LL6 1578 aa23.97■■□□□ 1.43
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Peg3Q3URU2 1571 aa23.95■■□□□ 1.42
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.94■■□□□ 1.42
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Lmo4-207ENSMUST00000196264 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Med1Q925J9 1575 aa23.91■■□□□ 1.42
Lmo4-207ENSMUST00000196264 HrcG5E8J6 738 aa23.89■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nos1Q9Z0J4 1429 aa23.89■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa23.89■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Slc34a2Q9DBP0 697 aa23.88■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rsph4aQ8BYM7 716 aa23.87■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Setd5Q5XJV7 1441 aa23.86■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abcc6Q9R1S7 1498 aa23.86■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pcf11G3X9Z4 1553 aa23.84■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Tiam1Q60610 1591 aa23.83■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Amigo3Q8C2S7 508 aa23.82■■□□□ 1.4
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ccnb3Q810T2 1396 aa23.81■■□□□ 1.4
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa23.8■■□□□ 1.4
Lmo4-207ENSMUST00000196264 NexmifQ5DTT1 1515 aa23.79■■□□□ 1.4
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Naip5Q9R016 1403 aa23.78■■□□□ 1.4
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lmod2Q3UHZ5 550 aa23.75■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Pik3c2aQ61194 1686 aa23.75■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kif21bQ9QXL1 1668 aa23.74■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adcy10Q8C0T9 1614 aa23.73■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gimap5Q8BWF2 308 aa23.73■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa23.73■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Caskin1Q6P9K8 1431 aa23.73■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kif3bQ61771 747 aa23.71■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adgrl1Q80TR1 1466 aa23.7■■□□□ 1.38
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Uggt2E9Q4X2 1504 aa23.69■■□□□ 1.38
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Sema6bO54951 886 aa23.68■■□□□ 1.38
Lmo4-207ENSMUST00000196264 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa23.67■■□□□ 1.38
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Asxl1P59598 1514 aa23.66■■□□□ 1.38
Lmo4-207ENSMUST00000196264 PtprvP70289 1705 aa23.63■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Brinp3Q499E0 766 aa23.63■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa23.62■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mbd5B1AYB6 1498 aa23.62■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa23.61■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Hfm1D3Z4R1 1434 aa23.61■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cntnap1O54991 1385 aa23.61■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa23.61■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Dmrt2Q8BG36 561 aa23.6■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Eea1Q8BL66 1411 aa23.59■■□□□ 1.37
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa23.58■■□□□ 1.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Qtrt2B8ZXI1 415 aa23.57■■□□□ 1.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rgs17Q9QZB0 210 aa23.57■■□□□ 1.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Plch2A2AP18 1501 aa23.54■■□□□ 1.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Fmn2Q9JL04 1578 aa23.54■■□□□ 1.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 MpndQ3TV65 487 aa23.54■■□□□ 1.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa23.54■■□□□ 1.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 CntlnA2AM05 1397 aa23.53■■□□□ 1.36
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ttll13A4Q9F6 804 aa23.5■■□□□ 1.35
Lmo4-207ENSMUST00000196264 MypopQ8R4U1 393 aa23.49■■□□□ 1.35
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Col18a1P39061 1774 aa23.48■■□□□ 1.35
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Setd1aE9PYH6 1716 aa23.46■■□□□ 1.35
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Prdm16A2A935 1275 aa23.45■■□□□ 1.34
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Robo2Q7TPD3 1470 aa23.44■■□□□ 1.34
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Siglec1Q62230 1695 aa23.43■■□□□ 1.34
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa23.42■■□□□ 1.34
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa23.42■■□□□ 1.34
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Lrp6O88572 1613 aa23.41■■□□□ 1.34
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Nwd1A6H603 1563 aa23.4■■□□□ 1.34
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Myo5cE9Q1F5 1742 aa23.39■■□□□ 1.34
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Abca17E9PX95 1733 aa23.37■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Txndc2Q6P902 515 aa23.37■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adamts7Q68SA9 1657 aa23.36■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa23.36■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 ShprhQ7TPQ3 1674 aa23.35■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa23.35■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Arap3Q8R5G7 1538 aa23.34■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa23.34■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Evi5lH3BKQ3 813 aa23.33■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ggt6Q6PDE7 497 aa23.33■■□□□ 1.33
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Prex1Q69ZK0 1650 aa23.3■■□□□ 1.32
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Mast1Q9R1L5 1570 aa23.29■■□□□ 1.32
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Kif13aQ9EQW7 1749 aa23.28■■□□□ 1.32
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Akap12Q9WTQ5 1684 aa23.28■■□□□ 1.32
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa23.25■■□□□ 1.31
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa23.25■■□□□ 1.31
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Slain2Q8CI08 581 aa23.25■■□□□ 1.31
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Zfp142G5E869 1843 aa23.24■■□□□ 1.31
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Col22a1E9Q7P1 1613 aa23.24■■□□□ 1.31
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Gm13695A2AK44 830 aa23.21■■□□□ 1.31
Lmo4-207ENSMUST00000196264 Znf526Q8BI66 675 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 158.9 ms