RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000116376.8

Sh3bp5l-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp5l, Length 3,016 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rgl3Q3UYI5 709 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cfap74Q3UY96 1578 aa17.39■□□□□ 0.38
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Hecw1Q8K4P8 1604 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Card11Q8CIS0 1159 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Slc24a1Q91WD8 1130 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Map4P27546 1125 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Clstn2Q9ER65 966 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ssh2Q5SW75 1423 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fgd6Q69ZL1 1399 aa17.33■□□□□ 0.36
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rtl5Q5DTT4 599 aa17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Arhgap5P97393 1501 aa17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abcc3B2RX12 1523 aa17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 NhsB1AV60 1647 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kdm5cP41230 1554 aa17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Robo2Q7TPD3 1470 aa17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Atp7aQ64430 1491 aa17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cd109Q8R422 1442 aa17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Trappc8E9PWG2 1437 aa17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm14025A2AP89 1413 aa17.25■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tarbp1E9Q368 1579 aa17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 AknaQ80VW7 1404 aa17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Supt16hQ920B9 1047 aa17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abca8bQ8K440 1620 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cep170Q6A065 1588 aa17.22■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Prdm16A2A935 1275 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 PrkcshO08795 521 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ofd1Q80Z25 1017 aa17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Adamts13Q769J6 1426 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abca17E9PX95 1733 aa17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 AI481877A2ALV5 1481 aa17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Chd1P40201 1711 aa17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mink1Q9JM52 1308 aa17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kank1E9Q238 1360 aa17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 ShprhQ7TPQ3 1674 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 L3mbtl2P59178 703 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 P3h3Q8CG70 732 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Plch2A2AP18 1501 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abcc1O35379 1528 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Sbno1Q689Z5 1390 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kidins220E9Q9B7 1793 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nsd2Q8BVE8 1365 aa17.11■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 AnkarA2RT91 1465 aa17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tulp4Q9JIL5 1547 aa17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zscan21Q07231 555 aa17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pola1P33609 1465 aa17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Atp10dQ8K2X1 1416 aa17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Uggt2E9Q4X2 1504 aa17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Liat1Q810M6 228 aa17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pde4cQ3UEI1 686 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tex14Q7M6U3 1450 aa17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 PrxO55103 1391 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Myo5cE9Q1F5 1742 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa17.04■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Igf1rQ60751 1373 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Erbb3Q61526 1339 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ttc41Q692V3 1318 aa17.03■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zfyve16Q80U44 1528 aa17.02■□□□□ 0.32
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 TnikP83510 1323 aa17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abcc6Q9R1S7 1498 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pank3Q8R2W9 370 aa17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa17■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa17■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tmf1B9EKI3 1091 aa16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Zscan10Q3URR7 782 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.5 ms