RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M HIR2P32480 875 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SLC1P33333 303 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SPC29P33419 253 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPS5P33759 307 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NUF2P33895 451 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRP8P35719 219 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL16P38064 232 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CHK1P38147 527 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR220CP38318 560 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YHL012WP38709 493 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YHL037CP38733 133 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR097CP38809 366 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data2.32□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M SWD1P39706 426 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M KRE29P40026 464 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M COG3P40094 801 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HXT9P40885 567 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MOB2P43563 287 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP57P48837 541 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DIA3P52290 468 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MPC1P53157 130 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GPI1P53306 609 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MAL12P53341 584 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SOK2P53438 785 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YNR062CP53748 327 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL033WP53964 284 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL019CP53975 284 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SUB1P54000 292 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HXT11P54862 567 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YKR011CQ02209 353 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP116Q02630 1113 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL077CQ02831 240 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SCS7Q03529 384 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HAS1Q03532 505 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SSY1Q03770 852 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR102CQ03864 110 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YAP6Q03935 383 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M AGE1Q04412 482 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HFD1Q04458 532 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DBP9Q06218 594 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC19Q07843 230 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NOP12Q08208 459 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CRT10Q08226 957 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M AVO1Q08236 1176 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HRT1Q08273 121 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GEP5Q12393 293 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL199CQ12407 687 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ADF1Q2V2Q1 113 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DFG16Q99234 619 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YOL087CQ99247 1116 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M Q0297Q9ZZV8 51 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M UTP20P35194 2493 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ATP2P00830 511 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SCO1P23833 295 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RHB1P25378 209 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CSM1P25651 190 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ITR1P30605 584 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ITR2P30606 609 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SNC1P31109 117 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DBF20P32328 564 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MCM10P32354 571 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ARP2P32381 391 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SSE1P32589 693 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M TIM12P32830 109 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL39P36533 70 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data2.31□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP4P38792 359 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR218WP38899 603 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M FET3P38993 636 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PIG2P40187 538 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YTA6P40328 754 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL166CP40445 542 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M AVT7P40501 490 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL012WP40551 113 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SNM1P40993 198 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GCN20P43535 752 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CAK1P43568 368 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DPB11P47027 764 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M DAM1P53267 343 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ACS1Q01574 713 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CIK1Q01649 594 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SKO1Q02100 647 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RRN5Q02983 363 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RSM28Q03430 361 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RCE1Q03530 315 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RSM24Q03976 319 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX12Q04370 399 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRPL1Q04599 285 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M VBA4Q04602 768 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RNH202Q05635 350 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG38Q05789 226 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M BCP1Q06338 283 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CTS2Q06350 511 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GPI11Q06636 219 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ASA1Q06822 443 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M THP1Q08231 455 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YPL191CQ08930 360 aa2.31□□□□□ -2.04
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