RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J HIR2P32480 875 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SLC1P33333 303 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC29P33419 253 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPS5P33759 307 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NUF2P33895 451 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRP8P35719 219 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL16P38064 232 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CHK1P38147 527 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR220CP38318 560 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL012WP38709 493 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL037CP38733 133 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR097CP38809 366 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data2.32□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J SWD1P39706 426 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J KRE29P40026 464 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J COG3P40094 801 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT9P40885 567 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MOB2P43563 287 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP57P48837 541 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DIA3P52290 468 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MPC1P53157 130 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI1P53306 609 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MAL12P53341 584 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SOK2P53438 785 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YNR062CP53748 327 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL033WP53964 284 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL019CP53975 284 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SUB1P54000 292 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT11P54862 567 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR011CQ02209 353 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP116Q02630 1113 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL077CQ02831 240 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SCS7Q03529 384 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HAS1Q03532 505 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SSY1Q03770 852 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR102CQ03864 110 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YAP6Q03935 383 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J AGE1Q04412 482 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HFD1Q04458 532 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DBP9Q06218 594 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC19Q07843 230 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP12Q08208 459 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CRT10Q08226 957 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J AVO1Q08236 1176 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HRT1Q08273 121 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GEP5Q12393 293 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL199CQ12407 687 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ADF1Q2V2Q1 113 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DFG16Q99234 619 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL087CQ99247 1116 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J Q0297Q9ZZV8 51 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP20P35194 2493 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP2P00830 511 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SCO1P23833 295 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RHB1P25378 209 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CSM1P25651 190 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ITR1P30605 584 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ITR2P30606 609 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SNC1P31109 117 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DBF20P32328 564 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MCM10P32354 571 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ARP2P32381 391 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SSE1P32589 693 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J TIM12P32830 109 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL39P36533 70 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data2.31□□□□□ -2.04not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP4P38792 359 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR218WP38899 603 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J FET3P38993 636 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PIG2P40187 538 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YTA6P40328 754 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL166CP40445 542 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J AVT7P40501 490 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL012WP40551 113 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SNM1P40993 198 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GCN20P43535 752 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CAK1P43568 368 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DPB11P47027 764 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DAM1P53267 343 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ACS1Q01574 713 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CIK1Q01649 594 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SKO1Q02100 647 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RRN5Q02983 363 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM28Q03430 361 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RCE1Q03530 315 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RSM24Q03976 319 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX12Q04370 399 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRPL1Q04599 285 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J VBA4Q04602 768 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RNH202Q05635 350 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG38Q05789 226 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J BCP1Q06338 283 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CTS2Q06350 511 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GPI11Q06636 219 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ASA1Q06822 443 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J THP1Q08231 455 aa2.31□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL191CQ08930 360 aa2.31□□□□□ -2.04
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