RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C PHO81P17442 1178 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C GIT1P25346 518 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C EDS1P38073 919 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C CHK1P38147 527 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C ZTA1P38230 334 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C HXT9P40885 567 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C YJR098CP47139 656 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C COX18P53239 316 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C COS1P53822 381 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C HXT11P54862 567 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C MMT1Q03218 510 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C SCS7Q03529 384 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C SRL1Q08673 210 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C NUR1Q12066 484 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C YKL018C-AQ3E7A7 99 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa3.17□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C TRP3P00937 484 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C SUI3P09064 285 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C TOP3P13099 656 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C NMT1P14743 455 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C RPB8P20436 146 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C ERG4P25340 473 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C MCM10P32354 571 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C HCS1P34243 683 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C MAE1P36013 669 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C LAS21P40367 830 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C PAC10P48363 199 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C COS6P53344 381 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C IRC15Q02733 499 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C YDR102CQ03864 110 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C VTI1Q04338 217 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C ARV1Q06541 321 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C DCI1Q08558 271 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C TMA46Q12000 345 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C YLR108CQ12259 485 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C JLP1Q12358 412 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C YOR343CQ12484 108 aa3.16□□□□□ -1.9
SUP53tL(CAA)C RHO2P06781 192 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C HTS1P07263 546 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C NAM2P11325 894 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C PET9P18239 318 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C ERD2P18414 219 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C URE2P23202 354 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C SED4P25365 1065 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C AAR2P32357 355 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C AUA1P32450 94 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C MTC7P32633 139 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YSC84P32793 468 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.15□□□□□ -1.91not detected
SUP53tL(CAA)C CAF4P36130 643 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C RIM2P38127 377 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YBL029WP38201 376 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C ISC1P40015 477 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C KRE29P40026 464 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C COG3P40094 801 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YJL068CP40363 299 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C INA22P40576 216 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C SMM1P53720 384 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YNL165WP53891 406 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C SLM2P53955 656 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C AGE1Q04412 482 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YKU80Q04437 629 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C IRC19Q07843 230 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YOL131WQ08270 108 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C SGT1Q08446 395 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C HMS1Q12398 434 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C MRX4Q12467 430 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C SNF8Q12483 233 aa3.15□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C HTA2P04912 132 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C ATP4P05626 244 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C HNM1P19807 563 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C APA2P22108 325 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C THI4P32318 326 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C GPX1P36014 167 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C BYE1P36106 594 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C BAP2P38084 609 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C TCM62P38228 572 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YCK3P39962 524 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C FIP1P45976 327 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C PUS4P48567 403 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C NAS6P50086 228 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C SHE4P51534 789 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C YIP5P53108 310 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C GOR1P53839 350 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C IST1P53843 298 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C ASI3P53983 676 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C GMC1Q04399 608 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C URC2Q04411 772 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C SML1Q04964 104 aa3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SUP53tL(CAA)C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
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