RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C TRM82Q03774 444 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YDR115WQ04598 105 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YOR376WQ08900 122 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YPQ1Q12010 308 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SLM3Q12093 417 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C UNG1P12887 359 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C TRX1P22217 103 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MIR1P23641 311 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PMT2P31382 759 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MKK1P32490 508 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C TOA1P32773 286 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C COS9P36034 407 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YBR241CP38142 488 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PRP39P39682 629 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SHE4P51534 789 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YGL114WP53134 725 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C CDH1P53197 566 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C VHT1P53241 593 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YNL146WP53906 100 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C KTR6P54070 446 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ECM11Q04110 302 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C CSM3Q04659 317 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C FRE8Q12209 686 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SPO24Q3E752 67 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C BI3Q9ZZW7 517 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ADH1P00330 348 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RAD1P06777 1100 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C VMA2P16140 517 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C CIN8P27895 1000 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PDC2P32896 925 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C IML3P38265 245 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RCK2P38623 610 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PEX22P39718 180 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YMR134WP40207 237 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C AIM23P47015 356 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C BIO3P50277 480 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C LSG1P53145 640 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RNH201P53942 307 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C TPS1Q00764 495 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SLT2Q00772 484 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PIN3Q06449 215 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MCH1Q07376 486 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C HIF1Q12373 385 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RGS2Q99188 309 aa1.42□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ASP3-2P0CX77 362 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ASP3-3P0CX78 362 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ASP3-4P0CX79 362 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ASP3-1P0CZ17 362 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ECT1P33412 323 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PEX32P38292 413 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C LIN1P38852 340 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YNL320WP42840 284 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YCH1P42937 148 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MOB2P43563 287 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YJR054WP47114 497 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C NAS6P50086 228 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YGR015CP53208 328 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SUR7P54003 302 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SPH1Q06160 661 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SRO7Q12038 1033 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RNR2P09938 399 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MYO3P36006 1272 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SHE1P38200 338 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C BTT1P40314 149 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C STB1P42845 420 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C VEL1P53058 206 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RMI1Q02685 241 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RPN6Q12377 434 aa1.41□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ERG9P29704 444 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SRB2P34162 210 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C DTR1P38125 572 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SMP1P38128 452 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C MMS21P38632 267 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C MRX11Q03079 207 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SCS7Q03529 384 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C DDC1Q08949 612 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C YDR262WQ12331 272 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C LDB17Q12342 491 aa1.4□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C STF1P01098 86 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C GAL3P13045 520 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C EPT1P22140 391 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C DCC1P25559 380 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C URA10P30402 227 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PCH2P38126 564 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SHE3P38272 425 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C CHL4P38907 458 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C POP2P39008 433 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PXR1P53335 271 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C BUR2Q05949 395 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C STE23Q06010 1027 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C ALE1Q08548 619 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C TAF10Q12030 206 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C PUT4P15380 627 aa1.39□□□□□ -2.19
HDA3YPR179C SUR1P33300 382 aa1.39□□□□□ -2.19
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