RNA–Protein interactions for RNA: YOR208W

PTP2, Transcript of Nuclear phosphotyrosine-specific phosphatase involved in osmosensing, yeast

Gene PTP2, Length 2,253 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTP2	YOR208W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	FRT2	P39734	528 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	CSM3	Q04659	317 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MMT2	Q08970	484 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	RPN6	Q12377	434 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	HMS1	Q12398	434 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	ERP4	Q12450	207 aa		0.94	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	GRR1	P24814	1151 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MKK1	P32490	508 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	TAE1	P38340	232 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	BDH1	P39714	382 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	EPL1	P43572	832 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	PEX27	Q08580	376 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	YDR018C	Q12185	396 aa		0.93	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	RAD1	P06777	1100 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MRPL8	P22353	238 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MXR2	P25566	168 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	COS9	P36034	407 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	IML3	P38265	245 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	YMR262W	P38430	313 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MOB2	P43563	287 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	TPC1	P53257	314 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	ZRG17	P53735	605 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	NAT4	Q04751	285 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	ECM19	Q06011	112 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	FRE6	Q12473	712 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	STE3	P06783	470 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	IME2	P32581	645 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	IST2	P38250	946 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	GGC1	P38988	300 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SNL1	P40548	159 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	YNR068C	P53754	272 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	PRM1	P53835	661 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	YMR010W	Q03687	405 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MRX8	Q05473	314 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MIM1	Q08176	113 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	HRT1	Q08273	121 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SRN2	Q99176	213 aa		0.92	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SAG1	P20840	650 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MRPS5	P33759	307 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	RXT2	P38255	430 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	TRR2	P38816	342 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	COS4	P43542	379 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	YFR018C	P43599	363 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MPS2	P53159	387 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	RPN14	P53196	417 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SED5	Q01590	340 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	INP1	Q03694	420 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	AST1	P35183	429 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	YKR015C	P36111	568 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	YHR182W	P38870	785 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SPO73	P40031	143 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	YIL059C	P40520	121 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	UFE1	P41834	346 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	DIA1	P54005	336 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	INP2	Q03824	705 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	GTO3	Q04806	366 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	UBA3	Q99344	299 aa		0.91	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SPS100	P13130	326 aa		0.9	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	CPT1	P17898	393 aa		0.9	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	TIP20	P33891	701 aa		0.9	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	SMF2	P38778	549 aa		0.9	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	RRG9	P40156	214 aa		0.9	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	FAR10	Q06001	478 aa		0.9	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	YFH1	Q07540	174 aa		0.9	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	LDB17	Q12342	491 aa		0.9	□□□□□ -2.26
PTP2	YOR208W	MAS1	P10507	462 aa		0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	HXT2	P23585	541 aa		0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.9	□□□□□ -2.27	not detected
PTP2	YOR208W	SRB2	P34162	210 aa		0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	ZRT3	P34240	503 aa		0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	FMP48	P53233	369 aa		0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	NRM1	P53718	249 aa		0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	YNL143C	P53908	130 aa		0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	YDR222W	Q04925	415 aa		0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	CDC42	P19073	191 aa		0.89	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	CIN8	P27895	1000 aa		0.89	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	RBG1	P39729	369 aa		0.89	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	YNL320W	P42840	284 aa		0.89	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	YHC3	P47040	408 aa		0.89	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	ALE1	Q08548	619 aa		0.89	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	APC5	Q08683	685 aa		0.89	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	SPO24	Q3E752	67 aa		0.89	□□□□□ -2.27
PTP2	YOR208W	STE2	D6VTK4	431 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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