RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	VMA22	P38784	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	FMO1	P38866	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YHR177W	P38867	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	AIM2	P39721	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	FAU1	P40099	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	RRG9	P40156	214 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	HOC1	P47124	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	STE24	P47154	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SRB7	P47822	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MSE1	P48525	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SPT20	P50875	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	COS12	P53053	380 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ORM1	P53224	222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YGR079W	P53249	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	AQR1	P53943	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SMA1	Q02651	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TRM82	Q03774	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	URC2	Q04411	772 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TEN1	Q07921	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PEX27	Q08580	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ACF2	Q12168	779 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MRX4	Q12467	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	BET2	P20133	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PRP28	P23394	588 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	HIR2	P32480	875 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	KKQ8	P36004	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TUL1	P36096	758 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	EHT1	P38295	451 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SBE22	P38814	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MET30	P39014	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YER010C	P40011	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	FCY21	P40039	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	VRG4	P40107	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MOB1	P40484	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YIL077C	P40508	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	APQ12	P40532	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PAC10	P48363	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ARG7	Q04728	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PEX10	Q05568	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SIA1	Q12212	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PNS1	Q12412	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
TRS33	YOR115C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	NDC1	P32500	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	LOT5	P34234	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ZRT3	P34240	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PCL6	P40038	420 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	DDI1	P40087	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YGR201C	P42936	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PRM10	P42946	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YFR018C	P43599	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	DIE2	P50076	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	UBC11	P52492	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MRH4	P53166	561 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	RIM13	Q03792	727 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	RNH202	Q05635	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	COA4	Q05809	96 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PDR8	Q06149	701 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ARO10	Q06408	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	AIM6	Q07716	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SFM1	Q12314	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YCK1	P23291	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PTC6	P25646	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	OAC1	P32332	324 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SPT14	P32363	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MNN2	P38069	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SCO2	P38072	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	RRN10	P38204	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	FMP23	P38231	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	BIG1	P38813	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
TRS33	YOR115C	YJL193W	P39542	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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