RNA–Protein interactions for RNA: YOR048C

RAT1, Transcript of Nuclear 5' to 3' single-stranded RNA exonuclease, yeast

Gene RAT1, Length 3,021 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAT1	YOR048C	TAD2	P47058	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PEX21	P50091	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	OKP1	P53298	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	CAF40	P53829	373 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NSE5	Q03718	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	CYK3	Q07533	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SGA1	P08019	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	CDC23	P16522	626 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RRN10	P38204	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NDE1	P40215	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YTA6	P40328	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ATH1	P48016	1211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RAD17	P48581	401 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	VOA1	P53262	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	AQR1	P53943	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	BOP2	Q06150	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	FUS1	P11710	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YJU3	P28321	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YEF1	P32622	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	FMP23	P38231	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YBR071W	P38243	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ATG14	P38270	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	HXT5	P38695	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	GEP4	P38812	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NEO1	P40527	1151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NAS2	P40555	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SPT20	P50875	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	VHS1	Q03785	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	FEX1	Q08913	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SRF1	Q12516	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NFS1	P25374	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YMC1	P32331	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PET127	P32606	800 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	VPS17	P32913	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ECM31	P38122	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PAU24	P38155	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RRF1	P38771	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SDP1	P40479	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	AIM25	P47140	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ECM27	P47144	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ROG1	P53118	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MPS2	P53159	387 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YGR026W	P53217	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	GOR1	P53839	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ASI3	P53983	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
RAT1	YOR048C	YML096W	Q04489	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NAT4	Q04751	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	INP53	Q12271	1107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SUL2	Q12325	893 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	COX3	P00420	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TFS1	P14306	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ORC2	P32833	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	LOT5	P34234	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MBA1	P38300	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MSS4	P38994	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SSO2	P39926	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	BAP3	P41815	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PRM10	P42946	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PFA4	Q12006	378 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RED1	P14291	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MDL1	P33310	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	KKQ8	P36004	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	THI2	P38141	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	HEM14	P40012	539 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	BIT61	P47041	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NUP57	P48837	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	EAF1	Q06337	982 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SCP1	Q08873	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ERD2	P18414	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YCL002C	P25565	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	FHN1	P53279	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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