RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	LOA1	Q06508	300 aa		3.23	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	YER186C	P40101	306 aa		3.23	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	YGR210C	P42942	411 aa		3.23	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	APC4	Q04601	652 aa		3.23	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	RCK1	P38622	512 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	YAR1	P46683	200 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	VOA1	P53262	265 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	CRH1	P53301	507 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	YNL146W	P53906	100 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	RRT8	Q08219	342 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	IZH2	Q12442	317 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	CBS2	P14905	389 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	YHR131C	P38835	850 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	TIS11	P47977	285 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	JID1	Q12350	301 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	YOL085C	Q99345	113 aa		3.22	□□□□□ -1.89
DSS1	YMR287C	ATP6	P00854	259 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.21	□□□□□ -1.9	not detected
DSS1	YMR287C	RBG1	P39729	369 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	YIL029C	P40538	142 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	YFL067W	P43537	175 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	TPC1	P53257	314 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	CDC14	Q00684	551 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	BUR2	Q05949	395 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	MIM1	Q08176	113 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	ATP16	Q12165	160 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	RBD2	Q12270	262 aa		3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PRB1	P09232	635 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	LOH1	P47055	219 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	LSB1	P53281	241 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	TIP41	Q12199	356 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PCL9	Q12477	304 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	MCH2	P36032	473 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	SHE1	P38200	338 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	NDT80	P38830	627 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	YJR054W	P47114	497 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	MND1	P53102	219 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PRM6	Q04705	352 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	EAF3	Q12432	401 aa		3.2	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	COX2	P00410	251 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PET123	P17558	318 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	MIG3	P39943	394 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	SCS3	P53012	380 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	MTQ1	P53944	314 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PRM4	Q12498	284 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	MSF1	P08425	469 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	ACB1	P31787	87 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	ECT1	P33412	323 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	TPO5	P36029	618 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	GAB1	P41733	394 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	GDS1	P41913	522 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PMT4	P46971	762 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	YJR030C	P47101	745 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	NDE2	Q07500	545 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	YLL007C	Q07799	665 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	APC2	Q12440	853 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	FMP16	Q12497	93 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	UBA3	Q99344	299 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	UNG1	P12887	359 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	GPI12	P23797	304 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	DAL2	P25335	343 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	CDC50	P25656	391 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PET8	P38921	284 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	PET100	P38958	111 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	END3	P39013	349 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	YGR168C	P53293	376 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DSS1	YMR287C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9

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