RNA–Protein interactions for RNA: YML116W

ATR1, Transcript of Multidrug efflux pump of the major facilitator superfamily, yeast

Gene ATR1, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATR1	YML116W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	GAL4	P04386	881 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	MXR2	P25566	168 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	CSM1	P25651	190 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	YKR015C	P36111	568 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	YCR041W	P37265	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	YER085C	P40058	173 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	VRG4	P40107	337 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	SRL4	Q03085	281 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	FUS2	Q05670	677 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	GPN3	Q06543	272 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	MDM36	Q06820	579 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	YRM1	Q12340	786 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	YPR1	Q12458	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATR1	YML116W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
ATR1	YML116W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	CWP1	P28319	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	TOA2	P32774	122 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YET1	P35723	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	GAT1	P43574	510 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YGR168C	P53293	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	GIM3	P53900	129 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	ARK1	P53974	638 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	TPO3	Q06451	622 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	BSP1	Q06604	576 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	MSF1	P08425	469 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	SPO12	P17123	173 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YHL026C	P38740	315 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YIP1	P53039	248 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YAP7	Q08182	245 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	REX4	Q08237	289 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	BTS1	Q12051	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	UBA3	Q99344	299 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	TOR1	P35169	2470 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	COX4	P04037	155 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	HEM2	P05373	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YCR007C	P25354	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	KRE6	P32486	720 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	TMT1	P32643	299 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	PEX2	P32800	271 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YMR262W	P38430	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	SIM1	P40472	476 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	SPP2	Q02521	185 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	VPS60	Q03390	229 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	NAT4	Q04751	285 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RGS2	Q99188	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	UTR1	P21373	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	MRPS5	P33759	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	DOA1	P36037	715 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YBR056W	P38081	501 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
ATR1	YML116W	YMR134W	P40207	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	GLO2	Q05584	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	OSW1	Q08692	278 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	TPK3	P05986	398 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	FAR1	P21268	830 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	ITR1	P30605	584 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	CSE2	P33308	149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	PHD1	P36093	366 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	ATG7	P38862	630 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YIR016W	P40572	265 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	OTU1	P43558	301 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	NAS6	P50086	228 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	CGR1	P53188	120 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	FRE4	P53746	719 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	MSS11	Q03825	758 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	CAC2	Q04199	468 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	BSC1	Q12140	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	ATG31	Q12421	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RRI1	Q12468	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	TEL1	P38110	2787 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	RAD1	P06777	1100 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	GLN3	P18494	730 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	DAL81	P21657	970 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATR1	YML116W	COS9	P36034	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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