RNA–Protein interactions for RNA: YLL049W

LDB18, Transcript of Component of the dynactin complex, yeast

Gene LDB18, Length 540 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LDB18	YLL049W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	GTR2	P53290	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	IRC15	Q02733	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	RSM28	Q03430	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	INP1	Q03694	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	RIM13	Q03792	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	ECM11	Q04110	302 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	VPS74	Q06385	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	APC9	Q12107	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	DMC1	P25453	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	RPD3	P32561	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	YOR062C	P36025	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	EXO84	P38261	753 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	PHO89	P38361	574 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	STP2	P38704	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	JEM1	P40358	645 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	PTR3	P43606	678 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	BIO4	P53630	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	MRPL19	P53875	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	SLM2	P53955	656 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	PIN3	Q06449	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	ARR1	Q06596	294 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	RTR2	Q12378	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LDB18	YLL049W	MSS18	P08593	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	PHO81	P17442	1178 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	NGG1	P32494	702 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	FAT1	P38225	669 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	ECM14	P38836	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	PEX7	P39108	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	SMK1	P41808	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	QRI7	P43122	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	ABM1	P47146	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	AAD10	P47182	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	CIK1	Q01649	594 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	SKO1	Q02100	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
LDB18	YLL049W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	NMT1	P14743	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	SPO7	P18410	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	GTO1	P48239	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	NAS6	P50086	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	PEF1	P53238	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	GOR1	P53839	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	PRM15	Q03262	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	EKI1	Q03764	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	CTR86	P25355	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	RPC37	P36121	282 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	RIM2	P38127	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	PTC7	P38797	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	MOB2	P43563	287 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	MRK1	P50873	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	MTQ1	P53944	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	SED1	Q01589	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	SHR3	Q02774	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	RSM24	Q03976	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	COX20	Q04935	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	STE23	Q06010	1027 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	SRL2	Q12020	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	NPC2	Q12408	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	RHO2	P06781	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	MRPL25	P23369	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	TOD6	P34219	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	YJL068C	P40363	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	EGT2	P42835	1041 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	NUR1	Q12066	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	MCP1	Q12106	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	PET123	P17558	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	ROX1	P25042	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	YCL049C	P25577	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LDB18	YLL049W	STE14	P32584	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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