RNA–Protein interactions for RNA: YGR082W

TOM20, Transcript of Component of the TOM (translocase of outer membrane) complex, yeast

Gene TOM20, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM20	YGR082W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	PDC2	P32896	925 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	RCK2	P38623	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	YMR134W	P40207	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	AIM23	P47015	356 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	HIF1	Q12373	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	ECT1	P33412	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	YJR054W	P47114	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	MKC7	P53379	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	CIN8	P27895	1000 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	YBR241C	P38142	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	IML3	P38265	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	PEX32	P38292	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	SEO1	P39709	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	YGR015C	P53208	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	SUR7	P54003	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	SLT2	Q00772	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM20	YGR082W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	SHE1	P38200	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	BMT2	P38278	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	BIO3	P50277	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	YGL114W	P53134	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	COS9	P36034	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	NAS6	P50086	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	YNL146W	P53906	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	KTR6	P54070	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	RPN6	Q12377	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	PEX22	P39718	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	RMI1	Q02685	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	SCS7	Q03529	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	VHS1	Q03785	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	MYO3	P36006	1272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	MID2	P36027	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	SMP1	P38128	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	MMS21	P38632	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	MOB2	P43563	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	RNH201	P53942	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	SPH1	Q06160	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	ERG9	P29704	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	STE23	Q06010	1027 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	YDL012C	Q12489	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	RGS2	Q99188	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	SAL1	D6W196	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	STB1	P42845	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	TAF10	Q12030	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	SRB2	P34162	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	YNL320W	P42840	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	MRX11	Q03079	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	MCH1	Q07376	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	ALE1	Q08548	619 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM20	YGR082W	GAL3	P13045	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	MRPS9	P38120	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	CHL4	P38907	458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	PIN3	Q06449	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	DDC1	Q08949	612 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	DCC1	P25559	380 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	SMF2	P38778	549 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	VEL1	P53058	206 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	REX3	Q12090	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	LDB17	Q12342	491 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	PUT4	P15380	627 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	URA10	P30402	227 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	POP2	P39008	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	TAF6	P53040	516 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	SUR1	P33300	382 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	AIM20	P40451	204 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	VPS20	Q04272	221 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	EPT1	P22140	391 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	PCH2	P38126	564 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	RRT13	P40042	185 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TOM20	YGR082W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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