RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 EPB41P11171 864 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS19P49795 217 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 UBXN1Q04323 297 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ACVR2BQ13705 512 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MTERF2Q49AM1 385 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 GBP3Q9H0R5 595 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS16Q9H269 839 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 TAB2Q9NYJ8 693 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 SORBS3O60504 671 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PTGS1P23219 599 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NR2F2P24468 414 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 NPEPPSP55786 919 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 RETREG2Q8NC44 543 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PPTC7Q8NI37 304 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 APBA2Q99767 749 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 ERAP1Q9NZ08 941 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 SFI1A8K8P3 1242 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPK7Q13164 816 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MAEAQ7L5Y9 396 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CNGA4Q8IV77 575 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC51Q96ER9 411 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MKNK1Q9BUB5 465 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NRBP1Q9UHY1 535 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC169A6NNP5 214 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 HBP1O60381 514 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NCKAP1LP55160 1127 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CRHR2Q13324 411 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 EMC2Q15006 297 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 IRF2BP1Q8IU81 584 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PPFIA4O75335 1185 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 STBD1O95210 358 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ARIH2O95376 493 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NR3C1P04150 777 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PEX3P56589 373 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 VWA3BQ502W6 1294 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC55Q6ZSA7 311 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH11P35749 1972 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 GTF2BQ00403 316 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP1Q07960 439 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 DAW1Q8N136 415 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPC6Q9Y210 931 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CCP110O43303 1012 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NAMPTP43490 491 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 CASP5P51878 434 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFAIP2Q03169 654 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 STRN3Q13033 797 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 IER5Q5VY09 327 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 USP37Q86T82 979 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC9A9Q8IVB4 645 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM174Q8WUU8 243 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NDST4Q9H3R1 872 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PDLIM7Q9NR12 457 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 COL1A2P08123 1366 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF6Q15052 776 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 DGKDQ16760 1214 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 C12orf56Q8IXR9 622 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 DEPTORQ8TB45 409 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 STRA6Q9BX79 667 aa24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1-212ENST00000591041 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.83■■□□□ 1.57
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