RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 EVPLQ92817 2033 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR64B1ANS9 1081 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA2O43364 376 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 EDIL3O43854 480 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 OATP04181 439 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GNA11P29992 359 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 LLGL2Q6P1M3 1020 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SYCE2Q6PIF2 218 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ECHDC2Q86YB7 292 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 APOL5Q9BWW9 433 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC45O75419 566 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SRGAP2BP0DMP2 458 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCEQ02156 737 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 UGCGQ16739 394 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ABI1Q8IZP0 508 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF558Q96NG5 402 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 DISC1Q9NRI5 854 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 TMOD1P28289 359 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GPC3P51654 580 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC14Q08ET2 396 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF169Q8NCN4 708 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNB2Q92953 911 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 MSH4O15457 936 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 FGFR4P22455 802 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 ASIC4Q96FT7 647 aa28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP2AO43633 222 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 DARSP14868 501 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1AP35813 382 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NTRK3Q16288 839 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL6Q8N531 539 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 GJA10Q969M2 543 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 NRBP2Q9NSY0 501 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SPG21Q9NZD8 308 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH22Q9UJ99 828 aa28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-211ENST00000590874 SP100P23497 879 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT17Q04695 432 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN21Q16825 1174 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TMC7Q7Z402 723 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A11Q8N1S5 342 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 BICD2Q8TD16 824 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC45AQ9H3U1 944 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0U1RQF3 1178 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN5P54829 565 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 DRP2Q13474 957 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF710Q8N1W2 664 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 HELQQ8TDG4 1101 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SCLT1Q96NL6 688 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 RIT2Q99578 217 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GAS7O60861 476 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 VCPP55072 806 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF15Q12870 199 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP7Q8WX94 980 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC5A5Q92911 643 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA4P34932 840 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 LRCH2Q5VUJ6 765 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXL16Q8N461 479 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP10Q92851 521 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TEKT3Q9BXF9 490 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 AGXT2Q9BYV1 514 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf71A6NGG8 1288 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS6KB1P23443 525 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SFNP31947 248 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 USP11P51784 963 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 JAK3P52333 1124 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM150BA6NC51 233 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 EOMESO95936 686 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNAR1P17181 557 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 KMT2EQ8IZD2 1858 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP89Q96ST8 783 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRX2Q99811 253 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms