RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566677.1

C15orf41-209, Transcript of chromosome 15 open reading frame 41, humanhuman

TSL 2

Gene C15orf41, Length 5,843 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41-209ENST00000566677 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 BBOF1Q8ND07 529 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 RAD54LQ92698 747 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CDCA5Q96FF9 252 aa4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CHUKO15111 745 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 IFT88Q13099 833 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 COG2Q14746 738 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 WDR44Q5JSH3 913 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CCDC89Q8N998 374 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 VPS16Q9H269 839 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 PNMA3Q9UL41 463 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 TRAF5O00463 557 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ARHGEF9O43307 516 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CDC25BP30305 580 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 COPB2P35606 906 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 PSMD7P51665 324 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 IL9RQ01113 521 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 NELFBQ8WX92 580 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 SPDL1Q96EA4 605 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 AGBL1Q96MI9 1066 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 WDR18Q9BV38 432 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 RRAGCQ9HB90 399 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 BAG5Q9UL15 447 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 FZD1Q9UP38 647 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 HPSEQ9Y251 543 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 TBX3O15119 743 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 TBC1D8O95759 1140 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 PRELPP51888 382 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 SNAPC2Q13487 334 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CUL4BQ13620 913 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 VGLL4Q14135 290 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 PDIA5Q14554 519 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 RPS6KA2Q15349 733 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 GNPTABQ3T906 1256 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 MB21D1Q8N884 522 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 MTMR8Q96EF0 704 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 FAM20AQ96MK3 541 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ACAD9Q9H845 621 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 RNF146Q9NTX7 359 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 PANK4Q9NVE7 773 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 DOCK1Q14185 1865 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 SLC37A4O43826 429 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 USP2O75604 605 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 DSG3P32926 999 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 GUCY2FP51841 1108 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 JAG1P78504 1218 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 GRIN1Q05586 938 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 GPBP1Q86WP2 473 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 KLHL29Q96CT2 875 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 GSDMAQ96QA5 445 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 IWS1Q96ST2 819 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 AMFRQ9UKV5 643 aa4.7□□□□□ -1.66
C15orf41-209ENST00000566677 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms