RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IGSF3O75054 1194 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IGHA2P01877 340 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GNAT1P11488 350 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GJB2P29033 226 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 BECN1Q14457 450 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CALCRLQ16602 461 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NEK8Q86SG6 692 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 E9PMD0 336 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 AMHP03971 560 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PSAPP07602 524 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 KRT2P35908 639 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GRIN1Q05586 938 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IL17RAQ96F46 866 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 EPHX3Q9H6B9 360 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NRCAMQ92823 1304 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 OR1G1P47890 313 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ANO5Q75V66 913 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 DYMQ7RTS9 669 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CEP120Q8N960 986 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 POF1BQ8WVV4 589 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 RAD9AQ99638 391 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ALPK3Q96L96 1907 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ACACBO00763 2458 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 HIDE1A8MVS5 230 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 WDR64B1ANS9 1081 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ASGR2P07307 311 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CASP1P29466 404 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SREBF1P36956 1147 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TMX3Q96JJ7 454 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GAD1Q99259 594 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PRDM4Q9UKN5 801 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 DNAJB1P25685 340 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ABHD15Q6UXT9 468 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GPRASP2Q96D09 838 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CLIC6Q96NY7 704 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ZBTB22O15209 634 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NEMFO60524 1076 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IDEP14735 1019 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 KCNA4P22459 653 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TMOD1P28289 359 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 BMP8BP34820 402 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ERVFC1P60507 584 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PTGDRQ13258 359 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PKP1Q13835 747 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 USP49Q70CQ1 688 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TMEM192Q8IY95 271 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 HERVK_113Q902F9 699 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CDHR1Q96JP9 859 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 INSL6Q9Y581 213 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ERLIN2O94905 339 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms