RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MAF1Q9H063 256 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CEP350Q5VT06 3117 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MAP2K7O14733 419 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZSCAN12O43309 604 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FECHP22830 423 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CCND2P30279 289 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MAN2A1Q16706 1144 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MIIPQ5JXC2 388 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 LRRC31Q6UY01 552 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SFR1Q86XK3 245 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 UBXN4Q92575 508 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CEP63Q96MT8 703 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ACAD9Q9H845 621 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 BATF3Q9NR55 127 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KCND2Q9NZV8 630 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TRAF5O00463 557 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZBTB39O15060 712 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TADA3O75528 432 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FAM13AO94988 1023 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GNA14O95837 355 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FAM163BP0C2L3 166 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 RSPH10BP0C881 870 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GAP43P17677 238 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 EPHX2P34913 555 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CASP5P51878 434 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PLS1Q14651 629 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 VWA3BQ502W6 1294 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TREML2Q5T2D2 321 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KAT2BQ92831 832 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CDCA5Q96FF9 252 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NUP58Q9BVL2 599 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 OLFML3Q9NRN5 406 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TTC26A0AVF1 554 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 STK25O00506 426 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 SASH3O75995 380 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 NR3C2P08235 984 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MYBP10242 640 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KRT9P35527 623 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 JAK3P52333 1124 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 PPATQ06203 517 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MMRN1Q13201 1228 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 MYBPC2Q14324 1141 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 BRD3Q15059 726 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 EDRF1Q3B7T1 1238 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 LBX2Q6XYB7 198 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-204ENST00000546621 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms