RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SESTD1Q86VW0 696 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ERICH1Q86X53 443 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 JAMLQ86YT9 394 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 GALNT15Q8N3T1 639 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MORC4Q8TE76 937 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ITFG2Q969R8 447 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 BICD1Q96G01 975 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.7□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ITGB4P16144 1822 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 LINGO3P0C6S8 592 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ITGA4P13612 1032 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 UCHL3P15374 230 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 KLC1Q07866 573 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SLC29A2Q14542 456 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 DYMQ7RTS9 669 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PNMA5Q96PV4 448 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MTUS1Q9ULD2 1270 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CACNA1SQ13698 1873 aa11.69□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ENO4A6NNW6 628 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 DCTN3O75935 186 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 GNAZP19086 355 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 STAT1P42224 750 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PLTPP55058 493 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 INHBEP58166 350 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 KCNH2Q12809 1159 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 STRN3Q13033 797 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 UBE4AQ14139 1066 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 EXOC3L4Q17RC7 722 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 IRGCQ6NXR0 463 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 STK32AQ8WU08 396 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PIGBQ92521 554 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 VTI1AQ96AJ9 217 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MTMR9Q96QG7 549 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CYP39A1Q9NYL5 469 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PFASO15067 1338 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PASKQ96RG2 1323 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 BCL9O00512 1426 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PDLIM1O00151 329 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RIPK2O43353 540 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TTLL1O95922 423 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 SHBGP04278 402 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RXRBP28702 533 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 TXKP42681 527 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 IFNAR2P48551 515 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ADAM9Q13443 819 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 PARP10Q53GL7 1025 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 NUGGCQ68CJ6 796 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ADGRA1Q86SQ6 560 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 RHOT2Q8IXI1 618 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 HPS3Q969F9 1004 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 MAGEB18Q96M61 343 aa11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
LMO3-215ENST00000537304 FAM192AQ9GZU8 254 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms