RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531006.1

TSTA3-213, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-213ENST00000531006 A0A087WZ62 844 aa23■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 DENND3A2RUS2 1198 aa23■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 SMC3Q9UQE7 1217 aa23■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 MYO7AQ13402 2215 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 DGKIO75912 1065 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 OR52Z1P0C646 297 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 FIBCD1Q8N539 461 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 RGS18Q9NS28 235 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.99■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 EPC2Q52LR7 807 aa22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 ODR4Q5SWX8 454 aa22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 TMEM192Q8IY95 271 aa22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 IL27Q8NEV9 243 aa22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 KIF3AQ9Y496 699 aa22.98■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 H3BQV1 296 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 DSC3Q14574 896 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 NLRP4Q96MN2 994 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 COL4A6Q14031 1691 aa22.97■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 C9IYK1 514 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 MED24O75448 989 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 STAG3L1P0CL83 205 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 TRAPPC10P48553 1259 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 PTGDRQ13258 359 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.96■■□□□ 1.27
TSTA3-213ENST00000531006 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 RFC5P40937 340 aa22.95■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 EMC2Q15006 297 aa22.95■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.95■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.95■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 LYPLA2O95372 231 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 LINC00271P0C7V0 271 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 CTNNB1P35222 781 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 GPM6BQ13491 265 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 NEK9Q8TD19 979 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 FGFR1P11362 822 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 FAM189BP81408 668 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 CDC42EP1Q00587 391 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 RNF169Q8NCN4 708 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 MTRQ99707 1265 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 BMPR1AP36894 532 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 RARRES1P49788 294 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 CUL4AQ13619 759 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 IL17AQ16552 155 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 ECM1Q16610 540 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 POTEGQ6S5H5 508 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 ZNF410Q86VK4 478 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 SAMD11Q96NU1 681 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-213ENST00000531006 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.92■■□□□ 1.26
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