RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	THI4	P32318	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RNP1	P32385	249 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	JEN1	P36035	616 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	APT2	P36973	181 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MNN2	P38069	597 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MCM7	P38132	845 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	AXL2	P38928	823 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	VEL1	P53058	206 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	COS1	P53822	381 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RNH202	Q05635	350 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PDR8	Q06149	701 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	VPS36	Q06696	566 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	REX4	Q08237	289 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YNG1	Q08465	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PCL9	Q12477	304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	NIC96	P34077	839 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	KKQ8	P36004	724 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RRN10	P38204	145 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	CCT6	P39079	546 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	AIM2	P39721	246 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	FMP10	P40098	244 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	AZF1	P41696	914 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	LSB6	P42951	607 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	NUP57	P48837	541 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SPT20	P50875	604 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YLR173W	Q06247	608 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	ASR1	Q06834	288 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	ATG31	Q12421	196 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	MTR10	Q99189	972 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SIR2	P06700	562 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SPS2	P08459	502 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	CDC34	P14682	295 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	APN1	P22936	367 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PRP28	P23394	588 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YSR3	P23501	404 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RPC34	P32910	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
PUS1	YPL212C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YRO2	P38079	344 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SHE1	P38200	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PEX28	P38848	579 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	HPA3	P39979	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PHM8	P40025	321 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	PRM10	P42946	383 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	LYS5	P50113	272 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	COS10	P52924	374 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	BUD9	P53226	547 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	DID2	P69771	204 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	BUR2	Q05949	395 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	SUL2	Q12325	893 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS1	YPL212C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PET54	P10834	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MTC2	P34246	357 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TUL1	P36096	758 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	NAT2	P37293	288 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MBP1	P39678	833 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MNT3	P40549	630 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	RAD17	P48581	401 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	ERV29	P53337	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MEP3	P53390	489 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MTQ1	P53944	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MSC1	Q03104	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PHO92	Q06390	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MLC2	Q06580	163 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	IPK1	Q06667	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	ATG10	Q07879	167 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	FRE5	Q08908	694 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SKS1	Q12505	502 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MDM35	O60200	86 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	HOP1	P20050	605 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65

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