RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YNL165W	P53891	406 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RSN1	Q03516	953 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RIM13	Q03792	727 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	NAT4	Q04751	285 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SET6	Q12529	373 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	DPB3	P27344	201 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	HEM3	P28789	327 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YSC84	P32793	468 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	CAF4	P36130	643 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ECM14	P38836	430 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	FAA2	P39518	744 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YER188W	P40103	239 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YIR020C	P40575	100 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SLS1	P42900	643 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	NAS6	P50086	228 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RCF2	P53721	224 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	CIK1	Q01649	594 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SKO1	Q02100	647 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	MRP51	Q02950	344 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RSM28	Q03430	361 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ARR1	Q06596	294 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	HNT3	Q08702	217 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	MED2	Q12124	431 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SNF8	Q12483	233 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	NPP1	P25353	742 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	DAL80	P26343	269 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	NUP2	P32499	720 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	STE14	P32584	239 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YEL043W	P32618	956 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	TAT1	P38085	619 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YBL029W	P38201	376 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YHR180W	P38868	163 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YJL068C	P40363	299 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YIL029C	P40538	142 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	URB2	P47108	1174 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	COS6	P53344	381 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YKU80	Q04437	629 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ENB1	Q08299	606 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RNH203	Q12338	110 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SCO1	P23833	295 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.87	□□□□□ -1.79	not detected
YNL057W	YNL057W	YKL102C	P34249	101 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YKL107W	P34251	309 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	COS9	P36034	407 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ECM34	P38728	170 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	LAS21	P40367	830 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	NCA3	P46955	337 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SBH2	P52871	88 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	IMA1	P53051	589 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YGR126W	P53274	230 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	IGO1	P53897	168 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	CRZ1	P53968	678 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SED1	Q01589	338 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RAD30	Q04049	632 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	URC2	Q04411	772 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YDL121C	Q07541	149 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	CRT10	Q08226	957 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SRL2	Q12020	392 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	JLP1	Q12358	412 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RTR2	Q12378	196 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	REP1	P03871	373 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	CLB2	P24869	491 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YCL049C	P25577	312 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	MLF3	P32047	452 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	PTC1	P35182	281 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SWH1	P35845	1188 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	YER121W	P40076	114 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	QDR2	P40474	542 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	VHR1	P40522	640 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	EGT2	P42835	1041 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.6 ms