RNA–Protein interactions for RNA: YMR246W

FAA4, Transcript of Long chain fatty acyl-CoA synthetase, yeast

Gene FAA4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAA4	YMR246W	DAL81	P21657	970 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	EMP70	P32802	667 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	UFE1	P41834	346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	GTO1	P48239	356 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	BRO1	P48582	844 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	UBP8	P50102	471 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	ECM11	Q04110	302 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	RBD2	Q12270	262 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	GIS3	Q12418	502 aa		4.9	□□□□□ -1.62
FAA4	YMR246W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	ERG11	P10614	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	SEN2	P16658	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	APD1	P38281	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	GUF1	P46943	645 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	URC2	Q04411	772 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RMD5	Q12508	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	TYR1	P20049	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	ELM1	P32801	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	ALP1	P38971	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	END3	P39013	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	ABM1	P47146	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YJR154W	P47181	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	MNT4	P53745	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	DUG3	P53871	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	GIS1	Q03833	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	AIM39	Q08223	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	FRE1	P32791	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YHR122W	P38829	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	VEL1	P53058	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	HSP31	Q04432	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YML096W	Q04489	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RRG8	Q06109	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	AFT2	Q08957	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	HFA1	P32874	2273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	BAR1	P12630	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RSM22	P36056	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	INM1	P38710	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YJR054W	P47114	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	IMA2	Q08295	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	OPI3	P05375	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YPS1	P32329	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	RSM25	P40496	264 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	SPG5	P42933	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	TRS85	P46944	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	TOS2	P50078	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	CGR1	P53188	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	TIM21	P53220	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	ORM2	Q06144	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	PEP5	P12868	1029 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YMC1	P32331	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	KKQ8	P36004	724 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	ROT2	P38138	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	TOS3	P43637	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YGL114W	P53134	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	SHR3	Q02774	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	BOP2	Q06150	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	ECM25	P32525	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	DSE1	P40077	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	ATM1	P40416	690 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	PAC11	P40960	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YHC3	P47040	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	KTR6	P54070	446 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	PEX27	Q08580	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAA4	YMR246W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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