RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W YGR210CP42942 411 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ALK1P43633 760 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DIE2P50076 525 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PYK2P52489 506 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DUO1P53168 247 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ERV14P53173 138 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YGR026WP53217 278 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W FMP48P53233 369 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PDR16P53860 351 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ERG13P54839 491 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YCL001W-AP87012 153 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W TIM10P87108 93 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W REG1Q00816 1014 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W OAZ1Q02803 292 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YPL080CQ02826 108 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MRP51Q02950 344 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W UME1Q03010 460 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SCS7Q03529 384 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SNU56Q03782 492 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W AIM32Q04689 311 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ROY1Q04847 553 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PEX10Q05568 337 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W HRT3Q12347 344 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W GTT2Q12390 233 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RMP1Q12530 201 aa3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DDP1Q99321 188 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PUT2P07275 575 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SCH9P11792 824 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MAS2P11914 482 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ATR1P13090 542 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W CBS2P14905 389 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MTF1P14908 341 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W UGA1P17649 471 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MIR1P23641 311 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YCR051WP25631 222 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W URA7P28274 579 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DEG1P31115 442 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MRPL9P31334 269 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ERG3P32353 365 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RNP1P32385 249 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SCM4P32564 187 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W KKQ8P36004 724 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SPC34P36131 295 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MRPL4P36517 319 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SRO77P38163 1010 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RRN10P38204 145 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RRT2P38332 387 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W POP4P38336 279 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SMF1P38925 575 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W FET3P38993 636 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W EXO1P39875 702 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PSF2P40359 213 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W HIS6P40545 261 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W OPT1P40897 799 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W GSM1P42950 618 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W RMD8P43620 662 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W ARC1P46672 376 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YJR030CP47101 745 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YGL108CP53139 140 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W COG7P53195 279 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W TIM21P53220 239 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YGR066CP53242 292 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DRN1P53255 507 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W BUD17P53727 317 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W HCH1P53834 153 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W DYN2Q02647 92 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YPL071CQ02864 156 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W URH1Q04179 340 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YDR109CQ04585 715 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MRPL1Q04599 285 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W TAF9Q05027 157 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W NKP2Q06162 153 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YLR456WQ06199 204 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W FRQ1Q06389 190 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YNG1Q08465 219 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W TCO89Q08921 799 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YPL257WQ08974 193 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W YOL107WQ12239 342 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W SUL2Q12325 893 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W MRX4Q12467 430 aa3.24□□□□□ -1.89
VFA1YER128W PSF1Q12488 208 aa3.24□□□□□ -1.89
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