RNA–Protein interactions for RNA: YER063W

THO1, Transcript of Conserved nuclear RNA-binding protein, yeast

Gene THO1, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THO1	YER063W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	MAS2	P11914	482 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	UNG1	P12887	359 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	PET123	P17558	318 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	MRPL8	P22353	238 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	YCL068C	P25593	260 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	CIN8	P27895	1000 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	YPS1	P32329	569 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	SKN1	P33336	771 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	YPI1	P43587	155 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	TOS3	P43637	560 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	GWT1	P47026	490 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	HMS2	P47175	358 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	SSN8	P47821	323 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	PCP1	P53259	346 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	GIM3	P53900	129 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	YNL050C	P53952	270 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	GPI15	P53961	229 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	YPR1	Q12458	312 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	NTE1	Q04958	1679 aa		2.97	□□□□□ -1.93
THO1	YER063W	GCN2	P15442	1659 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	QCR6	P00127	147 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YAR066W	P0CX18	203 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YHR214W	P0CX19	203 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	CTR86	P25355	563 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	BUB3	P26449	341 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	SPR1	P32603	445 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	BUD2	P33314	1104 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	ECT1	P33412	323 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	SKT5	P34226	696 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.96	□□□□□ -1.94	not detected
THO1	YER063W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	SEC9	P40357	651 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	MRX5	P47007	382 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YIP1	P53039	248 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	RSN1	Q03516	953 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	BUR2	Q05949	395 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	ECM7	Q06200	448 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YLL007C	Q07799	665 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	LDS2	Q08218	356 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	HNT3	Q08702	217 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	RNH203	Q12338	110 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YRM1	Q12340	786 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	SPO24	Q3E752	67 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.96	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	TPK3	P05986	398 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	IMA3	P0CW40	589 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	IMA4	P0CW41	589 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	LSB5	P25369	354 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	SUA5	P32579	426 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	TAE1	P38340	232 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YHR177W	P38867	453 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	FMC1	P40491	155 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	INA22	P40576	216 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YGL242C	P53066	181 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YGL185C	P53100	379 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	PET117	Q02771	107 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	SRL4	Q03085	281 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YMR102C	Q03177	834 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	BET5	Q03630	159 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	INP2	Q03824	705 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	IMA2	Q08295	589 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	MUM3	Q08750	479 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	BTS1	Q12051	335 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	TY3A-G	Q12173	290 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YOL107W	Q12239	342 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	YOR012W	Q12351	137 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	RKM5	Q12367	367 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	FMP16	Q12497	93 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	TY3A-I	Q99219	290 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	SPO14	P36126	1683 aa		2.95	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	BUD3	P25558	1636 aa		2.94	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	MER1	P16523	270 aa		2.94	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	CDC42	P19073	191 aa		2.94	□□□□□ -1.94
THO1	YER063W	ACB1	P31787	87 aa		2.94	□□□□□ -1.94

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