RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	ABZ2	Q03266	374 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	VID22	Q05934	901 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	MED11	Q99278	115 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SAM35	P14693	329 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YLF2	P38746	405 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	AVT6	P40074	448 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	MDV1	P47025	714 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	NCE101	Q02820	53 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YLR345W	Q06137	509 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	CRT10	Q08226	957 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YPR015C	Q12531	247 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SNF6	P18888	332 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	LYP1	P32487	611 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	ORC2	P32833	620 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	ECM4	P36156	370 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YEL068C	P39977	110 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	CUP9	P41817	306 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SHR5	P41912	237 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	CHA4	P43634	648 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	COS1	P53822	381 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	GRX5	Q02784	150 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	PEX25	Q02969	394 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	MET17	P06106	444 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YOL162W	P0CF19	215 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YCR100C	P25606	316 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YKL077W	P36081	392 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	PEX18	P38855	283 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	IPT1	P38954	527 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	CIN1	P40987	1014 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	RET2	P43621	546 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	TPO4	Q12256	659 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	FRE7	Q12333	620 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	NPC2	Q12408	173 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	TEL1	P38110	2787 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	ERD2	P18414	219 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	OAC1	P32332	324 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YPT7	P32939	208 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	ECM15	P35195	104 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	MCM7	P38132	845 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	GOS1	P38736	223 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SHE4	P51534	789 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	VCX1	Q99385	411 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	FLP1	P03870	423 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YBR139W	P38109	508 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	ALG3	P38179	458 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	NSG1	P38837	291 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YTA6	P40328	754 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YIL067C	P40514	678 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SNZ1	Q03148	297 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	MDM30	Q05930	598 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SYO1	Q07395	620 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	UIP4	Q08926	304 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SPC3	Q12133	184 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	TRM10	Q12400	293 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	APC2	Q12440	853 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	RIP1	P08067	215 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	EMP70	P32802	667 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	MDL1	P33310	695 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	ALP1	P38971	573 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	KRE29	P40026	464 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YIL166C	P40445	542 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	EXG2	P52911	562 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	AKR2	Q12013	749 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	SIA1	Q12212	622 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	YOS9	Q99220	542 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	DFG16	Q99234	619 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RNQ1	YCL028W	CWH43	P25618	953 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RNQ1	YCL028W	SNC1	P31109	117 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RNQ1	YCL028W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RNQ1	YCL028W	PUP2	P32379	260 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RNQ1	YCL028W	ARN2	P38724	620 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RNQ1	YCL028W	IRC6	P43615	237 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RNQ1	YCL028W	ASI1	P54074	624 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RNQ1	YCL028W	ARP10	Q04549	284 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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