RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TRADD	Q15628	312 aa		14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TAF4B	Q92750	862 aa		14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	NFU1	Q9UMS0	254 aa		14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FLOT1	O75955	427 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	RPS6KA1	Q15418	735 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CPXCR1	Q8N123	301 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	DGKZ	Q13574	1117 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CBWD6	Q4V339	395 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	NACC1	Q96RE7	527 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FIZ1	Q96SL8	496 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CNTNAP1	P78357	1384 aa		14.29	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	EPHB4	P54760	987 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	BORCS6	Q96GS4	357 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	SAMM50	Q9Y512	469 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TISP43	B9A030	160 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CEP104	O60308	925 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	EVI5	O60447	810 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FAM153B	P0C7A2	387 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ITGB5	P18084	799 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GUCY2F	P51841	1108 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TRAF1	Q13077	416 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FAM153C	Q494X1	144 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	NFIB	O00712	420 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	HIP1R	O75146	1068 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ABCB4	P21439	1286 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	INPP5B	P32019	993 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FMO5	P49326	533 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	JAM2	P57087	298 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	VPS36	Q86VN1	386 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	HOOK2	Q96ED9	719 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	14.28	□□□□□ -0.12	6e-7	■■■■■ 317.7
BRF1-222	ENST00000635152	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	RNF14	Q9UBS8	474 aa		14.28	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	EXOC3	O60645	756 aa		14.27	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		14.27	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	IFT20	Q8IY31	132 aa		14.27	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	IL31RA	Q8NI17	732 aa		14.27	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		14.27	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	COL20A1	Q9P218	1284 aa		14.27	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		14.27	□□□□□ -0.12
BRF1-222	ENST00000635152	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	LRRN2	O75325	713 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	KIF4A	O95239	1232 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	CAP2	P40123	477 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	PRKCI	P41743	596 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	STAT1	P42224	750 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	SLC15A2	Q16348	729 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	H2AFV	Q71UI9	128 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	USP38	Q8NB14	1042 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	RUFY1	Q96T51	708 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		14.27	□□□□□ -0.13
BRF1-222	ENST00000635152	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		14.27	□□□□□ -0.13

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms