RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRANK1	O15050	2925 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	MMP1	P03956	469 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	CTNNB1	P35222	781 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSMC5	P62195	406 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPM6B	Q13491	265 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	POTED	Q86YR6	584 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	ASB2	Q96Q27	587 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SEMA3B-215	ENST00000621029	TMEM150B	A6NC51	233 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	BTBD18	B2RXH4	712 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	EML1	O00423	815 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	TBX3	O15119	743 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPR32	O75388	356 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	DGKI	O75912	1065 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP2R5C	Q13362	524 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPRO	Q16827	1216 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAM2	Q99965	735 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	VAV3	Q9UKW4	847 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	ST3GAL1	Q11201	340 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	32.56	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	HAS1	Q92839	578 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	TNFRSF25	Q93038	417 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	DNM2	P50570	870 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	GUCY1B3	Q02153	619 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM228A	Q86W67	206 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	NLRP7	Q8WX94	980 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	EVPL	Q92817	2033 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029		H3BNC9	293 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	MGEA5	O60502	916 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	TFF2	Q03403	129 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	AAK1	Q2M2I8	961 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	BMPR1A	P36894	532 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	HLA-C	Q95604	372 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGS18	Q9NS28	235 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	COG5	Q9UP83	839 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	STBD1	O95210	358 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	CALCRL	Q16602	461 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	C8orf76	Q96K31	380 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SEMA3B-215	ENST00000621029	COL4A6	Q14031	1691 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	ATP2B1	P20020	1258 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPC3	P51654	580 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	EPHA7	Q15375	998 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	ANO5	Q75V66	913 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	KIF2C	Q99661	725 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTC3	P53804	2025 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	RB1	P06400	928 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	GATM	P50440	423 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	DRP2	Q13474	957 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CEP170P1	Q96L14	293 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	LXN	Q9BS40	222 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	RGL1	Q9NZL6	768 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SEMA3B-215	ENST00000621029	NEMF	O60524	1076 aa		32.48	■■■□□ 2.79

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