RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.35□□□□□ -1.23
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CLCN3-211ENST00000613795 USP17L21D6R901 530 aa7.35□□□□□ -1.23
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CLCN3-211ENST00000613795 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.34□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.34□□□□□ -1.23
CLCN3-211ENST00000613795 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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