RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 I3L4J1 428 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 C8orf34Q49A92 452 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 POTEGQ6S5H5 508 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 RNF149Q8NC42 400 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 ZFP42Q96MM3 310 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 TOX2Q96NM4 488 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 PRO3102Q9H379 93 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 GDAQ9Y2T3 454 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 RLFQ13129 1914 aa8.46□□□□□ -1.05
CS-212ENST00000548567 FSD2A1L4K1 749 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CABYRO75952 493 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 HELQQ8TDG4 1101 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PLA2G6O60733 806 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GJB5O95377 273 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NOVP48745 357 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 LPIN1Q14693 890 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SEPT8Q92599 483 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ZMYM6O95789 1325 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 LINC01553A4QN01 128 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CCDC169A6NNP5 214 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IL9P15248 144 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NDUFV1P49821 464 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GPM6BQ13491 265 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CD320Q9NPF0 282 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PARP2Q9UGN5 583 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 B4GALT5O43286 388 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 DEXIO95424 95 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NRIP1P48552 1158 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MTMR8Q96EF0 704 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 RNF39Q9H2S5 420 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IFNAR1P17181 557 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 EPC2Q52LR7 807 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PALB2Q86YC2 1186 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MAP7D2Q96T17 732 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 LXNQ9BS40 222 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 XBP1P17861 261 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 RSPH3Q86UC2 560 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SERINC5Q86VE9 423 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 EHMT1Q9H9B1 1298 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ENPP3O14638 875 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 EDIL3O43854 480 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 TGFB3P10600 412 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ST3GAL1Q11201 340 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 SNX17Q15036 470 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 IER5Q5VY09 327 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 FIBCD1Q8N539 461 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-212ENST00000548567 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.43□□□□□ -1.06
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