RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513595.1

FOXD1-201, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXD1, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-201ENST00000513595 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 FAM20AQ96MK3 541 aa14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 DACT1Q9NYF0 836 aa14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 COL20A1Q9P218 1284 aa14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 HPSEQ9Y251 543 aa14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.93□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 A0A1B0GVL5 298 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 MARCH6O60337 910 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 KINO60870 393 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 IQCF3P0C7M6 154 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 TXLNAP40222 546 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 SYKP43405 635 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 TRIM67Q6ZTA4 783 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 RNF135Q8IUD6 432 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 FBXL6Q8N531 539 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 DNERQ8NFT8 737 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 TIGD1Q96MW7 591 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 RMDN3Q96TC7 470 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 Q9Y3F1 56 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 PLXNA3P51805 1871 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 VPS13AQ96RL7 3174 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 NR1I2O75469 434 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 KCNJ6P48051 423 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 NDUFA8P51970 172 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 GRIN1Q05586 938 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 CEP55Q53EZ4 464 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 PRR16Q569H4 304 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 RETREG2Q8NC44 543 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 PXMP2Q9NR77 195 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 USP25Q9UHP3 1055 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 PROB1E7EW31 1015 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 FAM86B1E9PN63 330 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 SLC26A4O43511 780 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 STAM2O75886 525 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF202O95125 648 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 PDIA5Q14554 519 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 PGM5Q15124 567 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 IL17AQ16552 155 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 LENG9Q96B70 501 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC34Q96HJ3 373 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 IWS1Q96ST2 819 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 RAD9AQ99638 391 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
FOXD1-201ENST00000513595 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 LINC01553A4QN01 128 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 B4DLN1 442 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 MEIS1O00470 390 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 SMPD1P17405 629 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 CCND2P30279 289 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 TXKP42681 527 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 COL19A1Q14993 1142 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 HAS1Q92839 578 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 TNMDQ9H2S6 317 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 NR3C2P08235 984 aa14.88□□□□□ -0.03
FOXD1-201ENST00000513595 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms