RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	EDA	Q92838	391 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRX2	Q99811	253 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	SETD4	Q9NVD3	440 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYM6	O95789	1325 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	NEDD4	P46934	1319 aa		12.54	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFB3	P10600	412 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	LTBR	P36941	435 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP1A2	P50993	1020 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B4	P51659	736 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP4	P98171	946 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	COL19A1	Q14993	1142 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PGM5	Q15124	567 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PKN1	Q16512	942 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	USP26	Q9BXU7	913 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		12.53	□□□□□ -0.4
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM221	A6NGB7	291 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R296	226 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	WIPF1	O43516	503 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	GHR	P10912	638 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	SP2	Q02086	613 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	SP4	Q02446	784 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	POU4F2	Q12837	409 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	HOMER1	Q86YM7	354 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS33	Q8NF86	280 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	RILPL2	Q969X0	211 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMYND15	Q9H091	742 aa		12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511		B4E1Z4	1266 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01565	O15544	149 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX10	O75333	385 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR2M	P0CAP2	368 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOQ	P17081	205 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5C2	P49902	561 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAF1	Q13077	416 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	NEDD9	Q14511	834 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPH3	Q86UC2	560 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	IL31RA	Q8NI17	732 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRF2	D3W0D1	207 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	BACH1	O14867	736 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB5	O15062	677 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP1	P03956	469 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE1A	P54750	535 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TLR1	Q15399	786 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	PLVAP	Q9BX97	442 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	OPLAH	O14841	1288 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXC8	P31273	242 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM15	Q13444	863 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL7B	Q6UX53	244 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL6	Q8N531	539 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT23	Q9C075	422 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	COL4A6	Q14031	1691 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO7A	Q13402	2215 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	NRCAM	Q92823	1304 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	ENPP3	O14638	875 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	FIBP	O43427	364 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	NRIP1	P48552	1158 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	ZXDA	P98168	799 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	GHRHR	Q02643	423 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SKAP2-209	ENST00000497511	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41

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