RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 SLC29A2Q14542 456 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC6Q16204 474 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 MED24O75448 989 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 KRT15P19012 456 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 GCLMP48507 274 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 CASP5P51878 434 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 TNIP1Q15025 636 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 ECM1Q16610 540 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 CPXCR1Q8N123 301 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SH3GL2Q99962 352 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 IKZF4Q9H2S9 585 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SLC8A1P32418 973 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 KCNA1Q09470 495 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 PPP2R5AQ15172 486 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 GDF3Q9NR23 364 aa14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 AKAP3O75969 853 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 IFNB1P01574 187 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 GCKP35557 465 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 CETN2P41208 172 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SKOR1P84550 965 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SEPT2Q15019 361 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 RPAINQ86UA6 219 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 AMNQ9BXJ7 453 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SLIT3O75094 1523 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 PON1P27169 355 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 PCK1P35558 622 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SESN3P58005 492 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 ATP11AP98196 1134 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SETDB1Q15047 1291 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 FBF1Q8TES7 1133 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF653Q96CK0 615 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 RGPD5Q99666 1765 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 GRIN2DO15399 1336 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 ZBTB16Q05516 673 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 GRAPQ13588 217 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 OPLAHO14841 1288 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 TRIM37O94972 964 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 GPSM2P81274 684 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 QPCTQ16769 361 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 LONRF1Q17RB8 773 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 KAZNQ674X7 775 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 HGSNATQ68CP4 663 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 AADACL2Q6P093 401 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 IFT74Q96LB3 600 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SORBS3O60504 671 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 ITIH3Q06033 890 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SEMA3FQ13275 785 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SUN1O94901 812 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 ZNF543Q08ER8 600 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 SGO2Q562F6 1265 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 VCPKMTQ9H867 229 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 PARVGQ9HBI0 331 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.85□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 PJA2O43164 708 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.84□□□□□ -0.03
SGMS1-203ENST00000429490 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms