RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000206029.1

Snhg1-208, mouse

TSL 3 BASIC

Gene Snhg1, Length 408 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Nfkbid	Q2TB02	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Wdr18	Q4VBE8	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Il31	Q6EAL8	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Mtmr10	Q7TPM9	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Srsf12	Q8C8K3	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Pvr	Q8K094	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Upb1	Q8VC97	393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Fam111a	Q9D2L9	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Ptges3l	Q9D9A7	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Itga8	A2ARA8	1062 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Zfp942	B8JJA7	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Gm5795	E9PZN8	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Gm3187	M0QWW3	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Cyp1a1	P00184	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Stat3	P42227	770 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Pfkm	P47857	780 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Cdr2	P97817	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Sppl2b	Q3TD49	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Ccdc27	Q3V036	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Zc3h12a	Q5D1E7	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Lrmp	Q60664	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Manea	Q6NXH2	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Sez6l	Q6P1D5	963 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Abhd16b	Q80YU0	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Acsf2	Q8VCW8	615 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Oas3	Q8VI93	1138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Brms1	Q99N20	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Mllt1	Q9ERL0	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	C1ql3	Q9ESN4	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Npas3	Q9QZQ0	925 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Dpt	Q9QZZ6	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Clk2	O35491	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Ptgs1	P22437	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Stra8	P70278	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Sirpa	P97797	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Pim2	Q62070	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Wapl	Q65Z40	1200 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Rbm12b2	Q66JV4	834 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Zc3h11a	Q6NZF1	792 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Clec7a	Q6QLQ4	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Tas2r104	Q7M723	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029		Q8BP99	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Ipo13	Q8K0C1	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Znf131	Q8K3J5	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Pagr1a	Q99L02	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Col25a1	Q99MQ5	666 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Vmn1r40	Q9EQ46	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Rbm8a2	A0A0N4SUH6	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Soat2	O88908	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Polr3b	P59470	1133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Rpl10l	P86048	214 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Nxn	P97346	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Tek	Q02858	1122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Crisp3	Q03402	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Gdf3	Q07104	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Ube2fb	Q3UWQ3	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Slc9a7	Q8BLV3	726 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Gphn	Q8BUV3	769 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Chst15	Q91XQ5	561 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Rnf112	Q96DY5	654 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Hibadh	Q99L13	335 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Txnrd3	Q99MD6	652 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Rhobtb3	Q9CTN4	611 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Rbm8a	Q9CWZ3	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Ube2ql1	A0PJN4	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Tnfrsf18	O35714	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Adra1b	P97717	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Ssrp1	Q08943	708 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Hhipl1	Q14DK5	791 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Vwa5b2	Q3UR50	1248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Taar2	Q5QD17	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Poli	Q6R3M4	717 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Map3k11	Q80XI6	850 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029		Q8BZJ8	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Fdps	Q920E5	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Frmd7	A2AD83	703 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Mndal	D0QMC3	538 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Pfdn2	O70591	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Mmp9	P41245	730 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Adcyap1r1	P70205	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Dhrs11	Q3U0B3	260 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	BC049730	Q810N3	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Anks1b	Q8BIZ1	1259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Clmn	Q8C5W0	1052 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Npnt	Q91V88	561 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Prr32	A2AFE9	284 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Prr19	B2RW88	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Gm11397	F6V5V4	377 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Dapk3	O54784	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Srpk1	O70551	648 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Pde8a	O88502	823 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Grik1	Q60934	836 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Fam228a	Q8CDW1	299 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Il17rd	Q8JZL1	738 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Chrm5	Q920H4	532 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Etfdh	Q921G7	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Klb	Q99N32	1043 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Mgst3	Q9CPU4	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Ccdc105	Q9D4K7	499 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Snhg1-208	ENSMUST00000206029	Usp14	Q9JMA1	493 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.1 ms