Protein–RNA interactions for Protein: A2AFE9

Prr32, Proline-rich protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr32A2AFE9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Prr32A2AFE9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Prr32A2AFE9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Prr32A2AFE9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Prr32A2AFE9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Prr32A2AFE9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Prr32A2AFE9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Prr32A2AFE9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prr32A2AFE9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prr32A2AFE9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prr32A2AFE9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prr32A2AFE9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Prr32A2AFE9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prr32A2AFE9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prr32A2AFE9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prr32A2AFE9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Prr32A2AFE9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prr32A2AFE9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prr32A2AFE9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Prr32A2AFE9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prr32A2AFE9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prr32A2AFE9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prr32A2AFE9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prr32A2AFE9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr32A2AFE9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prr32A2AFE9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prr32A2AFE9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prr32A2AFE9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prr32A2AFE9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prr32A2AFE9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prr32A2AFE9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Prr32A2AFE9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prr32A2AFE9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prr32A2AFE9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prr32A2AFE9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prr32A2AFE9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Prr32A2AFE9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Prr32A2AFE9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prr32A2AFE9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prr32A2AFE9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prr32A2AFE9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prr32A2AFE9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prr32A2AFE9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prr32A2AFE9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Prr32A2AFE9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prr32A2AFE9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prr32A2AFE9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Prr32A2AFE9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prr32A2AFE9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prr32A2AFE9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prr32A2AFE9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prr32A2AFE9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prr32A2AFE9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prr32A2AFE9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prr32A2AFE9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr32A2AFE9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr32A2AFE9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prr32A2AFE9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr32A2AFE9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prr32A2AFE9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prr32A2AFE9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prr32A2AFE9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Prr32A2AFE9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Prr32A2AFE9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prr32A2AFE9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prr32A2AFE9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prr32A2AFE9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prr32A2AFE9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prr32A2AFE9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prr32A2AFE9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prr32A2AFE9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prr32A2AFE9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prr32A2AFE9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prr32A2AFE9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prr32A2AFE9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr32A2AFE9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prr32A2AFE9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prr32A2AFE9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prr32A2AFE9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prr32A2AFE9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr32A2AFE9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prr32A2AFE9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prr32A2AFE9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prr32A2AFE9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prr32A2AFE9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr32A2AFE9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prr32A2AFE9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr32A2AFE9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr32A2AFE9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prr32A2AFE9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prr32A2AFE9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prr32A2AFE9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prr32A2AFE9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prr32A2AFE9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prr32A2AFE9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prr32A2AFE9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prr32A2AFE9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prr32A2AFE9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prr32A2AFE9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prr32A2AFE9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms