Protein–RNA interactions for Protein: Q91V88

Npnt, Nephronectin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpntQ91V88 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NpntQ91V88 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NpntQ91V88 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NpntQ91V88 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NpntQ91V88 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NpntQ91V88 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NpntQ91V88 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NpntQ91V88 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NpntQ91V88 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NpntQ91V88 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NpntQ91V88 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NpntQ91V88 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NpntQ91V88 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NpntQ91V88 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NpntQ91V88 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NpntQ91V88 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NpntQ91V88 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NpntQ91V88 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NpntQ91V88 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NpntQ91V88 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NpntQ91V88 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NpntQ91V88 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NpntQ91V88 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NpntQ91V88 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NpntQ91V88 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NpntQ91V88 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NpntQ91V88 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NpntQ91V88 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NpntQ91V88 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NpntQ91V88 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NpntQ91V88 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NpntQ91V88 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NpntQ91V88 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NpntQ91V88 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NpntQ91V88 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NpntQ91V88 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NpntQ91V88 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NpntQ91V88 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NpntQ91V88 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NpntQ91V88 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NpntQ91V88 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NpntQ91V88 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NpntQ91V88 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NpntQ91V88 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NpntQ91V88 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NpntQ91V88 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NpntQ91V88 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NpntQ91V88 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NpntQ91V88 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NpntQ91V88 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NpntQ91V88 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NpntQ91V88 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NpntQ91V88 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NpntQ91V88 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NpntQ91V88 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NpntQ91V88 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NpntQ91V88 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NpntQ91V88 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NpntQ91V88 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NpntQ91V88 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NpntQ91V88 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NpntQ91V88 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpntQ91V88 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpntQ91V88 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NpntQ91V88 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NpntQ91V88 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NpntQ91V88 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NpntQ91V88 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NpntQ91V88 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NpntQ91V88 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NpntQ91V88 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NpntQ91V88 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NpntQ91V88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NpntQ91V88 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NpntQ91V88 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NpntQ91V88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NpntQ91V88 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NpntQ91V88 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NpntQ91V88 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NpntQ91V88 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NpntQ91V88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NpntQ91V88 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NpntQ91V88 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NpntQ91V88 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NpntQ91V88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NpntQ91V88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NpntQ91V88 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NpntQ91V88 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NpntQ91V88 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NpntQ91V88 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NpntQ91V88 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NpntQ91V88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NpntQ91V88 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NpntQ91V88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NpntQ91V88 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NpntQ91V88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpntQ91V88 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NpntQ91V88 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NpntQ91V88 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NpntQ91V88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms