Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0C1

Ipo13, Importin-13, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo13Q8K0C1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Ipo13Q8K0C1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ipo13Q8K0C1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ipo13Q8K0C1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ipo13Q8K0C1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ipo13Q8K0C1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ipo13Q8K0C1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Ipo13Q8K0C1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ipo13Q8K0C1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Ipo13Q8K0C1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ipo13Q8K0C1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ipo13Q8K0C1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ipo13Q8K0C1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ipo13Q8K0C1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ipo13Q8K0C1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ipo13Q8K0C1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ipo13Q8K0C1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ipo13Q8K0C1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ipo13Q8K0C1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ipo13Q8K0C1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ipo13Q8K0C1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ipo13Q8K0C1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ipo13Q8K0C1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ipo13Q8K0C1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ipo13Q8K0C1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ipo13Q8K0C1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ipo13Q8K0C1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ipo13Q8K0C1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ipo13Q8K0C1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ipo13Q8K0C1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ipo13Q8K0C1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ipo13Q8K0C1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ipo13Q8K0C1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ipo13Q8K0C1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ipo13Q8K0C1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ipo13Q8K0C1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ipo13Q8K0C1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ipo13Q8K0C1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ipo13Q8K0C1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ipo13Q8K0C1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ipo13Q8K0C1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ipo13Q8K0C1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ipo13Q8K0C1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ipo13Q8K0C1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ipo13Q8K0C1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ipo13Q8K0C1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ipo13Q8K0C1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ipo13Q8K0C1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ipo13Q8K0C1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ipo13Q8K0C1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ipo13Q8K0C1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ipo13Q8K0C1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ipo13Q8K0C1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ipo13Q8K0C1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ipo13Q8K0C1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ipo13Q8K0C1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ipo13Q8K0C1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ipo13Q8K0C1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ipo13Q8K0C1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ipo13Q8K0C1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ipo13Q8K0C1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ipo13Q8K0C1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ipo13Q8K0C1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ipo13Q8K0C1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ipo13Q8K0C1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ipo13Q8K0C1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ipo13Q8K0C1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ipo13Q8K0C1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ipo13Q8K0C1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ipo13Q8K0C1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ipo13Q8K0C1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ipo13Q8K0C1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ipo13Q8K0C1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ipo13Q8K0C1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ipo13Q8K0C1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ipo13Q8K0C1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ipo13Q8K0C1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ipo13Q8K0C1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ipo13Q8K0C1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ipo13Q8K0C1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ipo13Q8K0C1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ipo13Q8K0C1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ipo13Q8K0C1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ipo13Q8K0C1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ipo13Q8K0C1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ipo13Q8K0C1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ipo13Q8K0C1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ipo13Q8K0C1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ipo13Q8K0C1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ipo13Q8K0C1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ipo13Q8K0C1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ipo13Q8K0C1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ipo13Q8K0C1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ipo13Q8K0C1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ipo13Q8K0C1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ipo13Q8K0C1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ipo13Q8K0C1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ipo13Q8K0C1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ipo13Q8K0C1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ipo13Q8K0C1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
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