RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA ECT1P33412 323 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA YKR015CP36111 568 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA PEX22P39718 180 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA SNL1P40548 159 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA CTK3P46963 296 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA YGR018CP53211 109 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA YNR068CP53754 272 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA YLH47Q06493 454 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA LDB17Q12342 491 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA FAB1P34756 2278 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA YHR182WP38870 785 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA FSH2Q05015 223 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA YLR177WQ06251 628 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA ATP16Q12165 160 aa2.35□□□□□ -2.03
15S_rRNA15S_rRNA RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA UNG1P12887 359 aa2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA DAP2P18962 818 aa2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA DBR1P24309 405 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA SEH1P53011 349 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YPL107WQ02873 248 aa2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA FRE6Q12473 712 aa2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA FSH3Q99369 266 aa2.34□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA ASP3-2P0CX77 362 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA ASP3-3P0CX78 362 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA ASP3-4P0CX79 362 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA ASP3-1P0CZ17 362 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA THR4P16120 514 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RDS1P25611 832 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA TOA1P32773 286 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA COS9P36034 407 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA WSC4P38739 605 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA HEM14P40012 539 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RPA34P47006 233 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA FLC3P53121 802 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA APJ1P53940 528 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA NBL1Q3E7Y6 73 aa2.33□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA TPI1P00942 248 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA FAR1P21268 830 aa2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA GRR1P24814 1151 aa2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA ADH5P38113 351 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA SHE3P38272 425 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA CHL4P38907 458 aa2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YFL012WP43580 148 aa2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RNH201P53942 307 aa2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA UTP6Q02354 440 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA AIM33Q04516 312 aa2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YDR115WQ04598 105 aa2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA SFG1Q12507 346 aa2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA DET1Q99288 334 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA UBA3Q99344 299 aa2.32□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA MAS1P10507 462 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA HMX1P32339 317 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA SHE1P38200 338 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YJR030CP47101 745 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YGR015CP53208 328 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA LST7P53237 242 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA SLT2Q00772 484 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA GAS2Q06135 555 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA PIN3Q06449 215 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YOL075CQ08234 1294 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA AIM45Q12480 344 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YBR241CP38142 488 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YPT35P38815 214 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA APE4P38821 490 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RBG1P39729 369 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA AIM23P47015 356 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA BIO3P50277 480 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RNY1Q02933 434 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA IES4Q08561 116 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA SRO7Q12038 1033 aa2.31□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA BLI1P35727 113 aa2.3□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YHR122WP38829 231 aa2.3□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YJR054WP47114 497 aa2.3□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA EFM3P47163 339 aa2.3□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YNL143CP53908 130 aa2.3□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA DBP9Q06218 594 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RAX2Q12465 1220 aa2.3□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA CKI1P20485 582 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA PMT2P31382 759 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA PDC2P32896 925 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA ECM34P38728 170 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA CDH1P53197 566 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA TRM82Q03774 444 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA SMP3Q04174 516 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA YOR376WQ08900 122 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA SLM3Q12093 417 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA GLE1Q12315 538 aa2.29□□□□□ -2.04
15S_rRNA15S_rRNA RPS19AP07280 144 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.7 ms