RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B THP3Q12049 470 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YDL109CQ12103 647 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MED2Q12124 431 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PSF1Q12488 208 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YBL111CQ3E7Y5 667 aa0.55□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PHO5P00635 467 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RAS2P01120 322 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SIR3P06701 978 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GPH1P06738 902 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ARD1P07347 238 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PET111P08468 800 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YAR066WP0CX18 203 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR214WP0CX19 203 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PDR1P12383 1068 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ARO3P14843 370 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GUK1P15454 187 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SPB1P25582 841 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B HRR25P29295 494 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PPG1P32838 368 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PTR2P32901 601 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YPT7P32939 208 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B AUR1P36107 401 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B FES1P38260 290 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B BIT2P38346 545 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B DIA4P38705 446 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ARO9P38840 513 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RTT107P38850 1070 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SEC31P38968 1273 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL193WP39542 402 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SPC72P39723 622 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PFK26P40433 827 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YIL054WP40524 105 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B APQ12P40532 138 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RPR2P40571 144 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MAD2P40958 196 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SMK1P41808 388 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RET2P43621 546 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NIT2P47016 307 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SNX4P47057 423 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR149WP47177 404 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NSA1P53136 463 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MPS2P53159 387 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR017WP53210 297 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ARP5P53946 755 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B NUP100Q02629 959 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B KAP120Q02932 1032 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YPL109CQ02981 657 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS60Q03390 229 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YAP6Q03935 383 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B HOR7Q05827 59 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR172WQ06608 200 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR091CQ06833 770 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM6Q07716 390 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B AAD15Q08361 143 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B HNT3Q08702 217 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B FIT3Q08907 204 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RTC5Q12108 567 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YDL009CQ12210 107 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR010CQ12426 110 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TY1A-DR3Q12441 440 aa0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B DFM1Q12743 341 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RAS1P01119 309 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL39P04650 51 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ARG81P05085 880 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B OPI3P05375 206 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL6BP05739 176 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC37P06101 506 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GCR1P07261 785 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ALG7P07286 448 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GCD2P12754 651 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B KAR3P17119 729 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PRP4P20053 465 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SFL1P20134 766 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SUI2P20459 304 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPS28P21771 286 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SLY41P22215 453 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B TOM40P23644 387 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ERG4P25340 473 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B FEN2P25621 512 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B ERV1P27882 189 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B EHD3P28817 500 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B GDH2P33327 1092 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PEX6P33760 1030 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SIP2P34164 415 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B HES1P35843 434 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B SPP381P38282 291 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR184WP38299 523 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B OTU2P38747 307 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B AIM18P38884 321 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MET18P40469 1032 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RPS29BP41058 56 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YFL066CP43538 392 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B PHO86P46956 311 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B MPS3P47069 682 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B COS10P52924 374 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR015CP53208 328 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B LSC2P53312 427 aa0.53□□□□□ -2.32
tF(GAA)BtF(GAA)B RHO5P53879 331 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
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