RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C TEF4P36008 412 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YHL037CP38733 133 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YJL193WP39542 402 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C ECM10P39987 644 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C LSM4P40070 187 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C TDA10P42938 290 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YNR040WP53736 256 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MMT1Q03218 510 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C GRE1Q08969 168 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YOR214CQ12282 236 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C RPN6Q12377 434 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C SWM1Q12379 170 aa6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MET2P08465 486 aa6.26□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C PDX1P16451 410 aa6.26□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C CLB3P24870 427 aa6.26□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C OGG1P53397 376 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C DBP6P53734 629 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C ATG38Q05789 226 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MRL1Q06815 381 aa6.26□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C HEM4P06174 275 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C GAL3P13045 520 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C CTA1P15202 515 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C UTR1P21373 530 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C SCO1P23833 295 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C SSE1P32589 693 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MNN9P39107 395 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C CCT7P42943 550 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YFR054CP43622 192 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C DCP2P53550 970 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C DMA2P53924 522 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YPL039WQ03080 316 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C EKI1Q03764 534 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YKU80Q04437 629 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YPT6Q99260 215 aa6.25□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C TOP3P13099 656 aa6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MER1P16523 270 aa6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C EXO70P19658 623 aa6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MRE11P32829 692 aa6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C SIP2P34164 415 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MSY1P48527 492 aa6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C DIA3P52290 468 aa6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C SNX41Q04053 625 aa6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C SHE9Q04172 456 aa6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C RAF1Q06891 181 aa6.24□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C RNA1P11745 407 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MDH2P22133 377 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C RAD14P28519 371 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MRPL39P36533 70 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C ROT2P38138 954 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C RCK1P38622 512 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C SHO1P40073 367 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YNL208WP40159 199 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C IMA5P40884 581 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C ARC35P53731 342 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C CTL1Q03220 320 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C FMN1Q03778 218 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MCP1Q12106 302 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YDL211CQ12121 372 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C PSY3Q12318 242 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C NPC2Q12408 173 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YKL068W-AQ3E826 78 aa6.23□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C ATP6P00854 259 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C CCA1P21269 546 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C ZTA1P38230 334 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MTC4P38335 694 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C YHL012WP38709 493 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C LAS21P40367 830 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C AVT7P40501 490 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C IAH1P41734 238 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C LEM3P42838 414 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C RNR4P49723 345 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C MAL12P53341 584 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C ENB1Q08299 606 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C NSL1Q12143 216 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C DBP10Q12389 995 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C Q0297Q9ZZV8 51 aa6.22□□□□□ -1.41
SPE3YPR069C ARG3P05150 338 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C PDA1P16387 420 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C DEP1P31385 405 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C LHP1P33399 275 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C IST2P38250 946 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C TSC10P38342 320 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C GAT2P40209 560 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C GPP1P41277 250 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C YNR068CP53754 272 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C IGO1P53897 168 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RSN1Q03516 953 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MRPL1Q04599 285 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C MFG1Q07684 458 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C AVO1Q08236 1176 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C DCI1Q08558 271 aa6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SPE3YPR069C RSA1Q08932 381 aa6.21□□□□□ -1.42
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