RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W SNF5P18480 905 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W PTR2P32901 601 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W BAP2P38084 609 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SRO77P38163 1010 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ARN2P38724 620 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W EXG2P52911 562 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MAL11P53048 616 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YGR012WP53206 393 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W RNH70P53331 553 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ERG13P54839 491 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W NUP49Q02199 472 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W TFB3Q03290 321 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SMA2Q04658 369 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YPR172WQ06608 200 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YPR091CQ06833 770 aa8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W APN1P22936 367 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W IMG1P25626 169 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W CMK1P27466 446 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W TPO5P36029 618 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YBR139WP38109 508 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MBP1P39678 833 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YEL068CP39977 110 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W DDI1P40087 428 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W NTA1P40354 457 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W TIM54P47045 478 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W BAT2P47176 376 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W TOS2P50078 622 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YPL068CQ02749 293 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W DIC1Q06143 298 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YPR015CQ12531 247 aa8.7□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W CAR2P07991 424 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MCK1P21965 375 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W TOD6P34219 525 aa8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SEA4P38164 1038 aa8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W AMN1P38285 549 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W FMP52P40008 231 aa8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W RBG2P53295 368 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YDR541CQ03049 344 aa8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MFB1Q04922 465 aa8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MRX10Q05648 414 aa8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YDL211CQ12121 372 aa8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W RBD2Q12270 262 aa8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W IES3Q12345 250 aa8.69□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data8.68□□□□□ -1.02not detected
BRR1YPR057W LYP1P32487 611 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W PET112P33893 541 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W VPS51P36116 164 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W UTH1P36135 365 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W BET3P36149 193 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W FMP23P38231 175 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W FES1P38260 290 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ALP1P38971 573 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YTA6P40328 754 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W CFD1P40558 293 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SSY5P47002 699 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W TPC1P53257 314 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W COS1P53822 381 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SNZ1Q03148 297 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MDM36Q06820 579 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YOR365CQ08844 703 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YPL191CQ08930 360 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YOR214CQ12282 236 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MMP1Q12372 583 aa8.68□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SNF6P18888 332 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SEC61P32915 480 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ECM34P38728 170 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ANS1P38832 159 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W PEX18P38855 283 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MDM31P38880 579 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YHR219WP38900 624 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ZRG8P40021 1076 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W BUR6P40096 142 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W JLP2P40206 208 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YIL086CP40503 102 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W DBP6P53734 629 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YKR011CQ02209 353 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ELP6Q04868 273 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W CRT10Q08226 957 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SKM1Q12469 655 aa8.67□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YOL162WP0CF19 215 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MXR2P25566 168 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W NDC1P32500 655 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ARC19P33204 171 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W ECM15P35195 104 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MRPL15P36523 253 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W RPS27BP38711 82 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W PZF1P39933 429 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W GDI1P39958 451 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W YNL195CP40168 261 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W SMK1P41808 388 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W QRI7P43122 407 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W MAK3Q03503 176 aa8.66□□□□□ -1.02
BRR1YPR057W GRX3Q03835 250 aa8.66□□□□□ -1.02
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