RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	DAP2	P18962	818 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	MRPL8	P22353	238 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	PCL1	P24867	279 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YET2	Q04210	160 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	MFG1	Q07684	458 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	PSO2	P30620	661 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	ABM1	P47146	123 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YMR010W	Q03687	405 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	NFI1	Q12216	726 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	FUN26	P31381	517 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	MSK1	P32048	576 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	SPO23	P33757	523 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	UTH1	P36135	365 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	SNL1	P40548	159 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	MPS2	P53159	387 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	YNR068C	P53754	272 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YNL171C	YNL171C	CDC50	P25656	391 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	SHS1	Q07657	551 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	YOR338W	Q99326	363 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	SPT7	P35177	1332 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	IES6	P32617	166 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	OM14	P38325	134 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	YER186C	P40101	306 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	SEC9	P40357	651 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	RET3	P53600	189 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	GAT3	Q07928	141 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	HMS1	Q12398	434 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.31	□□□□□ -1.88	not detected
YNL171C	YNL171C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	TSA2	Q04120	196 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	MAS2	P11914	482 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	ZRC1	P20107	442 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	RDS1	P25611	832 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	PFS1	P38872	237 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	TIM17	P39515	158 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	AQR1	P53943	586 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	AIM33	Q04516	312 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	YPR078C	Q06813	372 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	BSC6	Q08280	497 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	GLE1	Q12315	538 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	FSH3	Q99369	266 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	PRB1	P09232	635 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	MAS1	P10507	462 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	GIT1	P25346	518 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.29	□□□□□ -1.88	not detected
YNL171C	YNL171C	DEP1	P31385	405 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	SIF2	P38262	535 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	YHR182W	P38870	785 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	CIN2	P46670	268 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	YNL143C	P53908	130 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	MSC3	Q05812	728 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	YLH47	Q06493	454 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	SFG1	Q12507	346 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	COX4	P04037	155 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	VAM7	P32912	316 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	IGD1	P43598	195 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YNL171C	YNL171C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	HEM4	P06174	275 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	STE3	P06783	470 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	STE7	P06784	515 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	OPI1	P21957	404 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	HMX1	P32339	317 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YNL171C	YNL171C	GPI18	P38211	433 aa		3.27	□□□□□ -1.89

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.6 ms