RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	MRPL39	P36533	70 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YBR220C	P38318	560 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	STP2	P38704	541 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YHL012W	P38709	493 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	PTR3	P43606	678 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NIT2	P47016	307 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YJR039W	P47107	1121 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	GOR1	P53839	350 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	ECM11	Q04110	302 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	COQ11	Q05892	277 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	VPS74	Q06385	345 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YLR040C	Q07988	224 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NUR1	Q12066	484 aa		3.93	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	ADH4	P10127	382 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	PBN1	P25580	416 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RPB9	P27999	122 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	CTS1	P29029	562 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	ITR1	P30605	584 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	HIR2	P32480	875 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NGG1	P32494	702 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	TOD6	P34219	525 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RIM2	P38127	377 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YIL165C	P40446	119 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	FAR3	P46671	204 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	GTO1	P48239	356 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	DAM1	P53267	343 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	MNT4	P53745	580 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SLM2	P53955	656 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	ACS1	Q01574	713 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	MRPL1	Q04599	285 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	COX20	Q04935	205 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YDR215C	Q12240	137 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	PSY3	Q12318	242 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RMP1	Q12530	201 aa		3.92	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	KSS1	P14681	368 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	UTR1	P21373	530 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YOR062C	P36025	268 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SCO2	P38072	301 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YHL044W	P38727	235 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SHU2	P38957	223 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	AAD10	P47182	288 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	PCP1	P53259	346 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YNL058C	P53947	316 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	EKI1	Q03764	534 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	STE23	Q06010	1027 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	RSC58	Q07979	502 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	VHS3	Q08438	674 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	YIG1	Q08956	461 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	BSC1	Q12140	328 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	NPC2	Q12408	173 aa		3.91	□□□□□ -1.78
YNL057W	YNL057W	CDC8	P00572	216 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	UNG1	P12887	359 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	CTR86	P25355	563 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	DMC1	P25453	334 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	EHD3	P28817	500 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ITR2	P30606	609 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	AYR1	P40471	297 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	SMK1	P41808	388 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	MOB2	P43563	287 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	PAC10	P48363	199 aa		3.9	□□□□□ -1.79
YNL057W	YNL057W	MRK1	P50873	501 aa		3.9	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26 ms