RNA–Protein interactions for RNA: YJL172W

CPS1, Transcript of Vacuolar carboxypeptidase S, yeast

Gene CPS1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPS1	YJL172W	AGC1	Q12482	902 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	RAD10	P06838	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	COS2	P0CX12	379 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	COS3	P0CX13	379 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	SNF4	P12904	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	URA6	P15700	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	PHO81	P17442	1178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YSP3	P25036	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	RHB1	P25378	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YCR015C	P25616	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	ARE1	P25628	610 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
CPS1	YJL172W	MLF3	P32047	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	PDR3	P33200	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	SEF1	P34228	1148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	ADD66	P36040	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	KAE1	P36132	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	ARA1	P38115	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	FIG1	P38224	298 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	ATG7	P38862	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	ECM10	P39987	644 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YEL028W	P39989	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	PIC2	P40035	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	LTP1	P40347	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	IDP2	P41939	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	MTQ1	P53944	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	PEX13	P80667	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	RSC9	Q03124	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	BUR2	Q05949	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	BSP1	Q06604	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	NRT1	Q08485	598 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	INP53	Q12271	1107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	SPE4	Q12455	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	RRD2	Q12461	358 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	AGP1	P25376	633 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	PTC6	P25646	442 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	MGT1	P26188	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	PHO91	P27514	894 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	DUG2	P38149	878 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YBR259W	P38338	688 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	FAA2	P39518	744 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	QRI7	P43122	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	OTU1	P43558	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	RRT5	P43607	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	MRK1	P50873	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	REG1	Q00816	1014 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	CTF19	Q02732	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	ADI1	Q03677	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	LDB18	Q07887	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	LCB4	Q12246	624 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	HTB2	P02294	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YIM1	P28625	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YOX1	P34161	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	SCD5	P34758	872 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	ALY1	P36117	915 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YHR078W	P38799	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	CYC2	P38909	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
CPS1	YJL172W	YER085C	P40058	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	MET28	P40573	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YJL107C	P42947	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	AGP3	P43548	558 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	TIM21	P53220	239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	PIR3	Q03180	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YAP6	Q03935	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	RSF1	Q05043	376 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	COS7	Q07788	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	NSL1	Q12143	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
CPS1	YJL172W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPS1	YJL172W	AFI1	Q99222	893 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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