RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	PEX7	P39108	375 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ACO2	P39533	789 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SAS2	P40963	338 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	BAP3	P41815	604 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	HOC1	P47124	396 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	IRC4	Q03036	179 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NUP53	Q03790	475 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RUP1	Q12242	671 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	GAL10	P04397	699 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	QCR2	P07257	368 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MXR2	P25566	168 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	IES6	P32617	166 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ELF1	P36053	145 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YPT10	P38146	199 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	JLP2	P40206	208 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YFR057W	P43625	151 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YJR056C	P47115	236 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NIF3	P53081	288 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ATG4	P53867	494 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YNL140C	P53910	189 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YML053C	Q04978	212 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	FRE7	Q12333	620 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SNA3	P14359	133 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	POP5	P28005	173 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NDC1	P32500	655 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SSO1	P32867	290 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	HMT1	P38074	348 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	FRT2	P39734	528 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PHM8	P40025	321 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SOK1	P40317	901 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ALG8	P40351	577 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	TOS2	P50078	622 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RSM23	Q01163	450 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MMT1	Q03218	510 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	OPT2	Q06593	877 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	IMA2	Q08295	589 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	DDC1	Q08949	612 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RGS2	Q99188	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CBS2	P14905	389 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	TMT1	P32643	299 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YJR149W	P47177	404 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PKP2	P53170	491 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ASR1	Q06834	288 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	THP1	Q08231	455 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	LCB4	Q12246	624 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PNS1	Q12412	539 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CHO1	P08456	276 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PPZ1	P26570	692 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
IKS1	YJL057C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	MYO3	P36006	1272 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ARP1	P38696	384 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	DBP8	P38719	431 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SRP14	P38985	146 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	VAB2	P40003	282 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SYG1	P40528	902 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	AIM24	P47127	394 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NAS6	P50086	228 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	CAC2	Q04199	468 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PEX10	Q05568	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	REV3	P14284	1504 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
IKS1	YJL057C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SHP1	P34223	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	COX16	P47081	118 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	UBP8	P50102	471 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	GND2	P53319	492 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	BUD17	P53727	317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	SED5	Q01590	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	NAT4	Q04751	285 aa		4.12	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75

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