RNA–Protein interactions for RNA: YJL038C

LOH1, Transcript of Protein involved in outer spore wall assembly, yeast

Gene LOH1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LOH1	YJL038C	ARR1	Q06596	294 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GRS2	Q06817	618 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	THP1	Q08231	455 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	VIK1	Q12045	647 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	VCX1	Q99385	411 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TAO3	P40468	2376 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YPR096C	O13587	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	HMG1	P12683	1054 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GAL3	P13045	520 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	AAC3	P18238	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	FAR1	P21268	830 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	PPZ1	P26570	692 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	HOG1	P32485	435 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SLC1	P33333	303 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SPO23	P33757	523 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YKR015C	P36111	568 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	FLO10	P36170	1169 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	ARA1	P38115	344 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MSS2	P40990	351 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	RET2	P43621	546 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SED5	Q01590	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	ARG7	Q04728	441 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	VPS74	Q06385	345 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	ARO10	Q06408	635 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	ATG33	Q06485	197 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	NMD4	Q12129	218 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YDL199C	Q12407	687 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	KSS1	P14681	368 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	BET2	P20133	325 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GSH1	P32477	678 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	NUP2	P32499	720 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	EMP70	P32802	667 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MRPL6	P32904	214 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	KKQ8	P36004	724 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	LHS1	P36016	881 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GGC1	P38988	300 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	POP2	P39008	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MET30	P39014	640 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GET2	P40056	285 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MPM1	P40364	252 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SMK1	P41808	388 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	FAR7	P43592	221 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YFR018C	P43599	363 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	COS12	P53053	380 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	IMO32	P53219	342 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	FHN1	P53279	174 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YNR061C	P53747	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GOR1	P53839	350 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	ATG4	P53867	494 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MRPL19	P53875	158 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MSC1	Q03104	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	RSN1	Q03516	953 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	APC4	Q04601	652 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SWF1	Q04629	336 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	COS7	Q07788	383 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	VPS68	Q12016	184 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	ATG29	Q12092	213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	USV1	Q12132	391 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SCM3	Q12334	223 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	TPK3	P05986	398 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MET17	P06106	444 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	CLB3	P24870	427 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	MEI5	P32489	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	ECM8	P38246	354 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	STP2	P38704	541 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	GOS1	P38736	223 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	YEL068C	P39977	110 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	COG3	P40094	801 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	VRG4	P40107	337 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	BIR1	P47134	954 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LOH1	YJL038C	ASK10	P48361	1146 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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