RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RGD2	P43556	714 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YGR168C	P53293	376 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ODC1	Q03028	310 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SLD5	Q03406	294 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SPS2	P08459	502 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ATP5	P09457	212 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FUN14	P18411	198 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CDC42	P19073	191 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YCL002C	P25565	263 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PPZ1	P26570	692 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AEP1	P32493	518 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PAH1	P32567	862 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	LIP5	P32875	414 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.45	□□□□□ -1.86	not detected
XRS2	YDR369C	TVP38	P36164	337 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FMO1	P38866	432 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ICP55	P40051	511 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SWM2	P40342	146 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GAB1	P41733	394 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TOS3	P43637	560 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AAD10	P47182	288 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RPN14	P53196	417 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TUB4	P53378	473 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RKM2	Q03942	479 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SSK1	Q07084	712 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TPO1	Q07824	586 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MED7	Q08278	222 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YOR365C	Q08844	703 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	VAM3	Q12241	283 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YLR126C	Q12288	251 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PSF1	Q12488	208 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MHF1	Q3E835	90 aa		3.45	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FLP1	P03870	423 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YER152C	P10356	443 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CSG2	P35206	410 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YKR051W	P36142	418 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MRPL36	P36531	177 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AVT2	P39981	480 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	POG1	P40473	351 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GLC8	P41818	229 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NET1	P47035	1189 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ALT2	P52892	507 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YNL181W	P53878	407 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NMA111	P53920	997 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	KIN4	Q01919	800 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MET14	Q02196	202 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MRP51	Q02950	344 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YDL129W	Q07555	291 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AIM6	Q07716	390 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AIM7	Q12156	149 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CAN1	P04817	590 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PDX1	P16451	410 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SNF6	P18888	332 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RHB1	P25378	209 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SNC1	P31109	117 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TIM23	P32897	222 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RCK1	P38622	512 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PEP8	P40335	379 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	OPT1	P40897	799 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	COG7	P53195	279 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NUP49	Q02199	472 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YPL080C	Q02826	108 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MAK3	Q03503	176 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ATC1	Q04005	294 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YDR124W	Q04608	324 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	MSC3	Q05812	728 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ECM30	Q06673	1274 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	REX4	Q08237	289 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FDH1	Q08911	376 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YPL257W	Q08974	193 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NMD4	Q12129	218 aa		3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YRR1	Q12172	810 aa		3.44	□□□□□ -1.86

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